91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1557 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  69.08 
 
 		 3682 aa  4100    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  100 
 
 		 3851 aa  7516    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1313 aa  494  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1245 aa  276  4.0000000000000004e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  34.89 
 
 		 946 aa  231  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0220  hypothetical protein  36.63 
 
 		 948 aa  206  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000317657  normal  0.15907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  29.51 
 
 		 938 aa  109  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  26.47 
 
 		 2833 aa  106  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  37.93 
 
 		 1140 aa  102  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  28.75 
 
 		 4978 aa  101  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  37.24 
 
 		 1488 aa  101  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  27.49 
 
 		 4071 aa  96.7  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  36.51 
 
 		 890 aa  92.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  22.71 
 
 		 1222 aa  88.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  25.85 
 
 		 1345 aa  80.5  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  23.96 
 
 		 1620 aa  80.1  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  24.45 
 
 		 541 aa  79  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  32.21 
 
 		 1466 aa  77.4  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  24.32 
 
 		 496 aa  76.3  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  22.94 
 
 		 3793 aa  75.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  24.04 
 
 		 1987 aa  74.7  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  32.28 
 
 		 535 aa  73.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  36.13 
 
 		 532 aa  72.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  23.14 
 
 		 1606 aa  72.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  37.86 
 
 		 642 aa  72.4  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  30.99 
 
 		 503 aa  71.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  29.05 
 
 		 3227 aa  72.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  31.54 
 
 		 540 aa  71.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  42.11 
 
 		 694 aa  70.1  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  29.01 
 
 		 1230 aa  70.1  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  27.94 
 
 		 636 aa  69.3  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  25.76 
 
 		 1228 aa  69.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  24.81 
 
 		 797 aa  68.6  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  40.43 
 
 		 915 aa  68.6  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  35.61 
 
 		 1331 aa  67.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  28.31 
 
 		 677 aa  67.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1287 aa  67.4  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  25.2 
 
 		 2278 aa  67.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  32.39 
 
 		 662 aa  66.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  40.58 
 
 		 2972 aa  66.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  30.65 
 
 		 650 aa  66.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  24.26 
 
 		 5544 aa  65.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  39.13 
 
 		 2980 aa  64.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.11 
 
 		 885 aa  64.3  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  22.75 
 
 		 886 aa  64.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  28.65 
 
 		 3542 aa  63.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  24.22 
 
 		 799 aa  62.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  31.25 
 
 		 658 aa  61.6  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  23.4 
 
 		 1602 aa  60.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  26.83 
 
 		 496 aa  59.7  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  36.99 
 
 		 3324 aa  59.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  40 
 
 		 652 aa  58.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1064 aa  57.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  22.99 
 
 		 3471 aa  57.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  31.96 
 
 		 1163 aa  57.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  32.61 
 
 		 640 aa  57.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  24.5 
 
 		 815 aa  56.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  27.02 
 
 		 1162 aa  56.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  30.61 
 
 		 5745 aa  56.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  30.28 
 
 		 490 aa  56.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  23.22 
 
 		 808 aa  55.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  32.61 
 
 		 4429 aa  55.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  38.89 
 
 		 598 aa  55.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  30.14 
 
 		 561 aa  55.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.98 
 
 		 4896 aa  54.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  40 
 
 		 429 aa  54.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  24.65 
 
 		 749 aa  53.9  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  28.93 
 
 		 1371 aa  53.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  27.43 
 
 		 1288 aa  53.5  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  26.37 
 
 		 1771 aa  53.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  27.06 
 
 		 1152 aa  53.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  31.46 
 
 		 967 aa  52  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  29.03 
 
 		 2377 aa  51.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  21.52 
 
 		 6497 aa  51.2  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  26.98 
 
 		 792 aa  50.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  25.18 
 
 		 2772 aa  50.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  25.52 
 
 		 822 aa  50.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  29.03 
 
 		 534 aa  50.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1059 aa  50.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  26.02 
 
 		 950 aa  49.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.78 
 
 		 627 aa  50.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  25.08 
 
 		 2270 aa  50.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1547 aa  48.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  27.56 
 
 		 3927 aa  48.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1139 aa  47.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  28.05 
 
 		 676 aa  47.8  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  24.87 
 
 		 5298 aa  47.4  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  23.01 
 
 		 3602 aa  47.8  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  31.93 
 
 		 637 aa  47.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  28.83 
 
 		 1302 aa  47.4  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  24.33 
 
 		 1980 aa  46.6  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>