106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4003 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  100 
 
 		 658 aa  1356    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  36.33 
 
 		 598 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  30.74 
 
 		 694 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  26.18 
 
 		 640 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  35 
 
 		 540 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  39.32 
 
 		 938 aa  81.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  40.91 
 
 		 2972 aa  79.7  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  49.28 
 
 		 890 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  31.36 
 
 		 642 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  38.64 
 
 		 652 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  38.37 
 
 		 1230 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  30.83 
 
 		 503 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  31.39 
 
 		 886 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  29.57 
 
 		 3542 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  41.86 
 
 		 1313 aa  74.3  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  29.61 
 
 		 535 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 1222 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  30.77 
 
 		 532 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  35.05 
 
 		 1466 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.22 
 
 		 885 aa  73.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  31.82 
 
 		 2980 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1163 aa  72.8  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  30.83 
 
 		 662 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  39.33 
 
 		 541 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  39.36 
 
 		 1620 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1287 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1488 aa  68.9  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  37.37 
 
 		 1140 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  30.26 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  37.08 
 
 		 1463 aa  67.8  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  35.23 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  37.11 
 
 		 1602 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  37.36 
 
 		 797 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  31.03 
 
 		 650 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  31.36 
 
 		 4429 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  30 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  28.1 
 
 		 677 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  37.04 
 
 		 636 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  38.2 
 
 		 637 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  27.54 
 
 		 950 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.77 
 
 		 3471 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  31.91 
 
 		 490 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  31.25 
 
 		 3851 aa  62  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  37.93 
 
 		 808 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  33.96 
 
 		 4071 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  40 
 
 		 792 aa  60.8  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  33.96 
 
 		 496 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  30.58 
 
 		 968 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  32.2 
 
 		 599 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  31.46 
 
 		 3324 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  29.7 
 
 		 711 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  36.76 
 
 		 1245 aa  58.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  30 
 
 		 561 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  35.42 
 
 		 969 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  30.83 
 
 		 794 aa  57.4  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  31.82 
 
 		 2833 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1228 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 1606 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  35.42 
 
 		 963 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  32.86 
 
 		 799 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.19 
 
 		 822 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  35.53 
 
 		 1987 aa  56.6  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.87 
 
 		 627 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  28.57 
 
 		 2377 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  32.79 
 
 		 3927 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  28.7 
 
 		 1059 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  29.37 
 
 		 803 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  31.08 
 
 		 5745 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.41 
 
 		 4896 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  32.47 
 
 		 871 aa  52.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  35.62 
 
 		 3682 aa  51.6  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 1162 aa  51.6  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  36.84 
 
 		 315 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  30.67 
 
 		 1389 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1064 aa  50.8  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  30.23 
 
 		 967 aa  50.1  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0459  leucine-rich repeat-containing protein  31.58 
 
 		 581 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.893142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  29.29 
 
 		 749 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  28.7 
 
 		 2421 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  23.08 
 
 		 1371 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1259 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  28.28 
 
 		 815 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  28.7 
 
 		 2454 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  29.35 
 
 		 2772 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1634 aa  48.1  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  29.63 
 
 		 2367 aa  48.1  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  35.06 
 
 		 2411 aa  47.8  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  28.7 
 
 		 2807 aa  47.8  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  31.58 
 
 		 676 aa  47.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  30.43 
 
 		 774 aa  47.4  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  34.25 
 
 		 750 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  28.89 
 
 		 726 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  31.34 
 
 		 2402 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1139 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  31.11 
 
 		 3793 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  32.43 
 
 		 1547 aa  45.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  32.18 
 
 		 1097 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4538  von Willebrand factor, type A  29.47 
 
 		 2588 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  25.44 
 
 		 2487 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  32.39 
 
 		 2364 aa  44.7  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>