152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2925 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1142    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1064 aa  321  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  36.84 
 
 		 2402 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4051  PKD domain-containing protein  34.12 
 
 		 2262 aa  212  1e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  28.57 
 
 		 1463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1804 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  26.68 
 
 		 1547 aa  131  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  25.83 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  30.87 
 
 		 532 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  27.37 
 
 		 5298 aa  126  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  28.63 
 
 		 6497 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  27.29 
 
 		 1222 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  25.62 
 
 		 885 aa  117  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  26.82 
 
 		 890 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  26.25 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  26.79 
 
 		 535 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  23.59 
 
 		 1139 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  27.33 
 
 		 874 aa  111  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2852  hypothetical protein  24.32 
 
 		 759 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536635  normal  0.285304 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  27.42 
 
 		 822 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1163 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  39.19 
 
 		 1162 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  24.54 
 
 		 815 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  25.21 
 
 		 792 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  23.71 
 
 		 534 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  25.87 
 
 		 2713 aa  93.6  8e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  29.35 
 
 		 938 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  38.79 
 
 		 1371 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1488 aa  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  42.53 
 
 		 627 aa  90.1  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  46.67 
 
 		 799 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  43.68 
 
 		 1389 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  23.64 
 
 		 3794 aa  84.3  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  24.79 
 
 		 1068 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  29.9 
 
 		 1483 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  23.8 
 
 		 794 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1313 aa  80.5  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  38.14 
 
 		 3227 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  24.36 
 
 		 4044 aa  79  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  30.22 
 
 		 636 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  37.07 
 
 		 637 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  23.71 
 
 		 5544 aa  77.4  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.49 
 
 		 1679 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  26.67 
 
 		 774 aa  76.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  43.18 
 
 		 2296 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.03 
 
 		 1466 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1059 aa  74.3  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  24.2 
 
 		 3958 aa  74.3  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1799  hypothetical protein  28.46 
 
 		 742 aa  73.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  24.76 
 
 		 652 aa  73.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  36.36 
 
 		 1193 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  39.08 
 
 		 1526 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  34.35 
 
 		 750 aa  72  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  31.86 
 
 		 429 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  26.44 
 
 		 1152 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  33.88 
 
 		 1140 aa  71.2  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  41.67 
 
 		 2927 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  39.77 
 
 		 1066 aa  70.1  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  40.23 
 
 		 2980 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  24.09 
 
 		 2833 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  42.7 
 
 		 2972 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  37.08 
 
 		 3542 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  29.22 
 
 		 2421 aa  68.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  29.22 
 
 		 2454 aa  68.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  29.3 
 
 		 2807 aa  68.2  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  33.63 
 
 		 2772 aa  67.8  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  28.89 
 
 		 2367 aa  67.4  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  28.89 
 
 		 2411 aa  67.4  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  25.87 
 
 		 3793 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  24.76 
 
 		 989 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  36.59 
 
 		 711 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  24.78 
 
 		 4071 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  26.48 
 
 		 797 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  25.95 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  34.44 
 
 		 2377 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  22.75 
 
 		 1097 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1287 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1259 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  26.65 
 
 		 2270 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  35.56 
 
 		 4896 aa  62  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  21.11 
 
 		 1620 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  29.03 
 
 		 662 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  31.97 
 
 		 808 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  32.58 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.52 
 
 		 1606 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  23.72 
 
 		 726 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  30.28 
 
 		 1245 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1980 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  37.5 
 
 		 599 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  31.82 
 
 		 2005 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  33.33 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  33.7 
 
 		 1230 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  32.98 
 
 		 3737 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1018  thermopsin  25.42 
 
 		 952 aa  57.8  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0978818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  36.26 
 
 		 3927 aa  57.4  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  32.61 
 
 		 871 aa  57.4  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  30 
 
 		 658 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  26.42 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  35.06 
 
 		 852 aa  57.4  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  34.78 
 
 		 3324 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>