90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1123 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  100 
 
 
1097 aa  2239    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  36.15 
 
 
774 aa  204  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01065  hypothetical protein  25.27 
 
 
860 aa  151  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00775  iron-regulated protein FrpC  25.27 
 
 
2364 aa  150  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  34.04 
 
 
726 aa  145  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06075  hypothetical protein  31.31 
 
 
766 aa  130  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.903534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06065  hypothetical protein  28.57 
 
 
873 aa  120  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.615706  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0979  hypothetical protein  39.42 
 
 
6497 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01070  hypothetical protein  28.95 
 
 
1030 aa  99.4  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  45.05 
 
 
1634 aa  95.1  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0033  Hyalin  30.81 
 
 
3958 aa  90.1  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  38.89 
 
 
5298 aa  84.7  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1336  Hyalin  35.78 
 
 
4044 aa  77.4  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  24.6 
 
 
792 aa  75.5  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  36.08 
 
 
3227 aa  71.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  34.48 
 
 
429 aa  68.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  28 
 
 
627 aa  68.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  33.87 
 
 
2064 aa  67.8  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3798  filamentous hemagglutinin outer membrane protein  26.7 
 
 
1526 aa  67  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0575475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  26.14 
 
 
967 aa  65.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  30.43 
 
 
2421 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.33 
 
 
2411 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  26.2 
 
 
1064 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  33.33 
 
 
2454 aa  64.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  33.33 
 
 
2367 aa  64.3  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  33.33 
 
 
2807 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  22.75 
 
 
561 aa  63.5  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  36.26 
 
 
1371 aa  63.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  23.89 
 
 
503 aa  62.4  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  30.56 
 
 
2927 aa  62.4  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  23.65 
 
 
532 aa  62  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0901  hypothetical protein  23.89 
 
 
1139 aa  61.6  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000794941 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  32.32 
 
 
1059 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  26.02 
 
 
540 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  26.29 
 
 
1245 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  34.09 
 
 
3737 aa  60.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  26.92 
 
 
750 aa  59.3  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  20.72 
 
 
534 aa  58.9  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  30.11 
 
 
1066 aa  58.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  24.77 
 
 
535 aa  58.5  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  30.77 
 
 
2296 aa  57.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  38.46 
 
 
799 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  35.23 
 
 
2005 aa  55.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  28.42 
 
 
822 aa  55.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  32 
 
 
637 aa  55.5  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  31.96 
 
 
1162 aa  55.1  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  21.74 
 
 
1313 aa  54.7  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  23.29 
 
 
2833 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  30.7 
 
 
2772 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  26.15 
 
 
1230 aa  53.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  30.23 
 
 
3542 aa  53.5  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  34.83 
 
 
598 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  30.93 
 
 
1287 aa  53.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  26.72 
 
 
1259 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  26.26 
 
 
3682 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3743  hypothetical protein  24.28 
 
 
1193 aa  53.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  19.86 
 
 
815 aa  52.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  34.26 
 
 
1140 aa  52.4  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  28.12 
 
 
1389 aa  52  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  33.33 
 
 
3602 aa  51.6  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  31.03 
 
 
886 aa  51.6  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  38.46 
 
 
1466 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  22.09 
 
 
1547 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  31.16 
 
 
496 aa  51.2  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  24.19 
 
 
4071 aa  50.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  29.17 
 
 
794 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  30.69 
 
 
808 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  29.27 
 
 
1606 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  30.23 
 
 
4429 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  24.7 
 
 
1163 aa  49.3  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  28.69 
 
 
541 aa  49.3  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  33.33 
 
 
1488 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  31.52 
 
 
650 aa  48.5  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  29.47 
 
 
1222 aa  48.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  38.71 
 
 
636 aa  47.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  34.29 
 
 
694 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  35.16 
 
 
885 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2774  hypothetical protein  29.1 
 
 
1804 aa  46.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.496989  hitchhiker  0.00218056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  25.11 
 
 
1602 aa  46.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  32.18 
 
 
658 aa  45.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  22.09 
 
 
938 aa  46.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  32.99 
 
 
642 aa  45.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.78 
 
 
4896 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  26.26 
 
 
599 aa  45.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 
1158 aa  45.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
944 aa  45.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1269  hypothetical protein  54.55 
 
 
874 aa  45.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  35 
 
 
852 aa  45.1  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  31.19 
 
 
944 aa  44.7  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  38.1 
 
 
677 aa  44.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>