95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2674 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1295    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  26.61 
 
 		 658 aa  177  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  29.28 
 
 		 694 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  26.12 
 
 		 598 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  41.94 
 
 		 890 aa  80.9  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  33.33 
 
 		 1140 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  26.77 
 
 		 652 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1287 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  42.22 
 
 		 532 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  31.62 
 
 		 540 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  38.3 
 
 		 1488 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  36.96 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  24.28 
 
 		 503 aa  71.2  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  31.69 
 
 		 650 aa  70.1  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  34.21 
 
 		 938 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  38.57 
 
 		 1245 aa  65.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  33.58 
 
 		 1163 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  23.33 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  32.98 
 
 		 1313 aa  64.7  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  36.99 
 
 		 490 aa  63.9  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.95 
 
 		 3542 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  35.79 
 
 		 1466 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  35.23 
 
 		 3324 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  38.04 
 
 		 1222 aa  62.4  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  33.65 
 
 		 711 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  33.9 
 
 		 1463 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  34.18 
 
 		 799 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  34.88 
 
 		 1230 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  30.43 
 
 		 662 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 541 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  32.08 
 
 		 886 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  38.36 
 
 		 4071 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  30.34 
 
 		 429 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  27.13 
 
 		 4429 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  34.25 
 
 		 792 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  32.58 
 
 		 637 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  32.98 
 
 		 1606 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  32.61 
 
 		 3851 aa  57.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  35.9 
 
 		 5745 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  31.82 
 
 		 2980 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  34.83 
 
 		 3682 aa  56.6  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1687  hypothetical protein  34.02 
 
 		 751 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.45992  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  30.53 
 
 		 496 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  32.98 
 
 		 1620 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  32.98 
 
 		 797 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1259 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  34.85 
 
 		 2972 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  29.2 
 
 		 636 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  29.06 
 
 		 534 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.93 
 
 		 1602 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  36 
 
 		 627 aa  54.3  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.07 
 
 		 3471 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1228 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  34.34 
 
 		 2833 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2273  hypothetical protein  40 
 
 		 871 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0229  hypothetical protein  27.6 
 
 		 963 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.449172 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0230  hypothetical protein  27.6 
 
 		 969 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.703793  normal  0.0560444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  34.48 
 
 		 2772 aa  51.6  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 		 599 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  31.34 
 
 		 1064 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  35.8 
 
 		 2367 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  35.8 
 
 		 2411 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  35.8 
 
 		 2454 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2421 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1646  conserved repeat domain protein  33.01 
 
 		 315 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0137205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1854  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1059 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00800733 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  28.85 
 
 		 967 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  35.8 
 
 		 2807 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  38.6 
 
 		 676 aa  48.9  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  35.21 
 
 		 950 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3968  hypothetical protein  32.29 
 
 		 968 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  28.06 
 
 		 1371 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  34.43 
 
 		 1483 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2552  hypothetical protein  34.83 
 
 		 750 aa  48.1  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.477149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  26.36 
 
 		 1987 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4934  hypothetical protein  31.4 
 
 		 774 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  25.97 
 
 		 1162 aa  47.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  27.17 
 
 		 496 aa  47.4  0.0008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  27.27 
 
 		 561 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2780  hypothetical protein  36.36 
 
 		 648 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167113  normal  0.164287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  31.46 
 
 		 815 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  36.62 
 
 		 3793 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2778  hypothetical protein  36.36 
 
 		 657 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.314072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  40 
 
 		 3927 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2684  PKD domain containing protein  33.78 
 
 		 1152 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.386868 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.09 
 
 		 1528 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  29.03 
 
 		 2402 aa  45.8  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1066 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  32.89 
 
 		 2270 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  28.71 
 
 		 2000 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  34.48 
 
 		 808 aa  44.7  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  26.56 
 
 		 1462 aa  44.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  43.75 
 
 		 794 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  39.29 
 
 		 2377 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  34.67 
 
 		 1042 aa  43.9  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>