80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0239 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  100 
 
 		 153 aa  308  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  49.24 
 
 		 302 aa  121  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  46.94 
 
 		 409 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  41.26 
 
 		 352 aa  114  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  43.97 
 
 		 570 aa  107  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.54 
 
 		 458 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  44.96 
 
 		 505 aa  97.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  37.84 
 
 		 638 aa  88.2  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.46 
 
 		 735 aa  88.2  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  34.29 
 
 		 375 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  39.44 
 
 		 635 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  40.77 
 
 		 471 aa  84.3  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  45.45 
 
 		 641 aa  84  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  36.55 
 
 		 871 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  33.33 
 
 		 960 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  35.62 
 
 		 341 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  32.41 
 
 		 1001 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  33.1 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  31.14 
 
 		 525 aa  71.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  33.33 
 
 		 1200 aa  61.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.11 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  36.89 
 
 		 940 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  31.31 
 
 		 564 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  32 
 
 		 360 aa  59.3  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  32.69 
 
 		 810 aa  57.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  29.3 
 
 		 467 aa  57  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  37.8 
 
 		 1755 aa  57  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  31.03 
 
 		 308 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  31.78 
 
 		 550 aa  53.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  27.92 
 
 		 547 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  31.25 
 
 		 417 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  32.17 
 
 		 501 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  29.46 
 
 		 437 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  29.3 
 
 		 899 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  28.46 
 
 		 863 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  32.52 
 
 		 297 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  28.67 
 
 		 429 aa  50.4  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2565  hypothetical protein  25.87 
 
 		 464 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041673 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  29.63 
 
 		 483 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  28.7 
 
 		 454 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 		 768 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1743  Cna B domain-containing protein  27.93 
 
 		 1384 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729601 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  32.11 
 
 		 2036 aa  48.5  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0354  hypothetical protein  43.14 
 
 		 536 aa  48.9  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332519 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  28.49 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  34.19 
 
 		 1750 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  32.11 
 
 		 1969 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  27.27 
 
 		 451 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  29.63 
 
 		 457 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  26.63 
 
 		 423 aa  46.2  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  26.63 
 
 		 423 aa  46.2  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  35.16 
 
 		 416 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  27.2 
 
 		 462 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  35.16 
 
 		 416 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  35.16 
 
 		 416 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  24.66 
 
 		 647 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  34.58 
 
 		 2272 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  35.56 
 
 		 400 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  34.07 
 
 		 400 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  28.57 
 
 		 453 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  22.07 
 
 		 441 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  26.47 
 
 		 454 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  29.66 
 
 		 648 aa  44.3  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4845  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.04 
 
 		 456 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0603533  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  24.14 
 
 		 674 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  24.77 
 
 		 1092 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  23.21 
 
 		 431 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.64 
 
 		 2031 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  23.21 
 
 		 431 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  47.37 
 
 		 844 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  28.3 
 
 		 445 aa  43.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  25.52 
 
 		 452 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0361  hypothetical protein  26.32 
 
 		 485 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  26.09 
 
 		 422 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  27.63 
 
 		 427 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  33.03 
 
 		 400 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  26.43 
 
 		 428 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  26.67 
 
 		 422 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  29.01 
 
 		 406 aa  40.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  27.72 
 
 		 410 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>