25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3553 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  100 
 
 
453 aa  926    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  32.43 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  28.21 
 
 
768 aa  83.2  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1778  hypothetical protein  24.44 
 
 
626 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2594  hypothetical protein  23.08 
 
 
683 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.397172 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  22.54 
 
 
509 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  21.83 
 
 
884 aa  57.4  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  24.91 
 
 
882 aa  57  0.0000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  21.6 
 
 
880 aa  57  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.64 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  22.73 
 
 
348 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  25.1 
 
 
402 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  23.02 
 
 
883 aa  52.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  29.05 
 
 
468 aa  51.6  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  21.97 
 
 
415 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  22.78 
 
 
911 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  24.52 
 
 
911 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  24.52 
 
 
911 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  22.3 
 
 
907 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.18 
 
 
413 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  23.18 
 
 
413 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  23.18 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  33.77 
 
 
525 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  28.57 
 
 
153 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  34.74 
 
 
520 aa  43.9  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>