24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0354 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0354  hypothetical protein  100 
 
 		 536 aa  1056    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332519 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  28.91 
 
 		 863 aa  139  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  29.11 
 
 		 1755 aa  68.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  42.68 
 
 		 1750 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  32.81 
 
 		 635 aa  62  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  31.5 
 
 		 153 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2565  hypothetical protein  24.9 
 
 		 464 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  24.19 
 
 		 427 aa  53.9  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  25.2 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  26.84 
 
 		 451 aa  52  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  25.57 
 
 		 570 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  26.27 
 
 		 1092 aa  50.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.52 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  22.58 
 
 		 462 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  32.08 
 
 		 302 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0361  hypothetical protein  36.36 
 
 		 485 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.28 
 
 		 884 aa  48.5  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.2 
 
 		 2031 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  29.77 
 
 		 172 aa  44.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  35.63 
 
 		 341 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  24 
 
 		 674 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  25.93 
 
 		 960 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  33.33 
 
 		 415 aa  43.9  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  22.26 
 
 		 439 aa  43.9  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>