121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1434 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  100 
 
 		 375 aa  753    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  32.85 
 
 		 871 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.31 
 
 		 735 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  38.34 
 
 		 505 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  31.17 
 
 		 635 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  30.54 
 
 		 471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  36.89 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  34.55 
 
 		 1092 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  36.5 
 
 		 570 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  36.87 
 
 		 638 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  39.66 
 
 		 409 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  38.92 
 
 		 777 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  41.67 
 
 		 302 aa  102  9e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  36.42 
 
 		 595 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  38.51 
 
 		 1931 aa  99.8  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  27.37 
 
 		 341 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  29.63 
 
 		 547 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  42.38 
 
 		 564 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  36.91 
 
 		 838 aa  95.9  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  36.79 
 
 		 1121 aa  94.4  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  30.66 
 
 		 707 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  45 
 
 		 810 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.22 
 
 		 458 aa  91.7  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  35.85 
 
 		 461 aa  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  38.3 
 
 		 641 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  40.31 
 
 		 245 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  28.49 
 
 		 500 aa  90.5  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  41.32 
 
 		 1035 aa  89.7  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  30.97 
 
 		 620 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  37.22 
 
 		 940 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  34.29 
 
 		 153 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  27.85 
 
 		 810 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  29.96 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  31.79 
 
 		 831 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  37.84 
 
 		 1001 aa  77.8  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  32.57 
 
 		 709 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  33.72 
 
 		 805 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  29.21 
 
 		 697 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  30.18 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  30.38 
 
 		 2036 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  30.38 
 
 		 1969 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  32.3 
 
 		 820 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  31.98 
 
 		 960 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  30.71 
 
 		 671 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  31.68 
 
 		 892 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  34.69 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  29.21 
 
 		 698 aa  70.1  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  34.71 
 
 		 1056 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  34.29 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  29.56 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  30.32 
 
 		 899 aa  68.9  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  29.63 
 
 		 1200 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  26.75 
 
 		 749 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  27.57 
 
 		 308 aa  67  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  30.77 
 
 		 294 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  32.11 
 
 		 648 aa  66.2  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  32.5 
 
 		 954 aa  66.2  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.25 
 
 		 510 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  28.31 
 
 		 724 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  29.59 
 
 		 2272 aa  61.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  53.7 
 
 		 919 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.71 
 
 		 677 aa  58.2  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  26.79 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  35.34 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  28.5 
 
 		 445 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  29.21 
 
 		 501 aa  55.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.62 
 
 		 464 aa  53.9  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.62 
 
 		 464 aa  53.9  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  25.89 
 
 		 720 aa  53.9  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  28.33 
 
 		 550 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  30.49 
 
 		 647 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.04 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  24.88 
 
 		 462 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  29.9 
 
 		 1332 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  31.61 
 
 		 685 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  23.29 
 
 		 431 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  23.29 
 
 		 431 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  29.07 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  27.84 
 
 		 442 aa  50.1  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  23.45 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  23.45 
 
 		 423 aa  50.1  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  23.7 
 
 		 452 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0688  Fibronectin type III domain protein  29.38 
 
 		 513 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  24.72 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  25 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  23.62 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.71 
 
 		 458 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  26.13 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.01 
 
 		 1750 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  25.12 
 
 		 451 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.71 
 
 		 458 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  23.83 
 
 		 428 aa  47.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  24.29 
 
 		 454 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  24.63 
 
 		 428 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  22.47 
 
 		 459 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  31.25 
 
 		 582 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.61 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.61 
 
 		 416 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  23.77 
 
 		 462 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  24.86 
 
 		 454 aa  46.6  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>