96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3393 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  100 
 
 		 564 aa  1129    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  37.31 
 
 		 1001 aa  271  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  47.49 
 
 		 810 aa  186  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  29.54 
 
 		 940 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  30.59 
 
 		 471 aa  156  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  27.72 
 
 		 960 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  32.15 
 
 		 641 aa  124  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 831 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  37.78 
 
 		 871 aa  120  6e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  38.29 
 
 		 635 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  33.21 
 
 		 638 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  33.11 
 
 		 805 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  33.22 
 
 		 820 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  34.1 
 
 		 892 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.01 
 
 		 1121 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  36.62 
 
 		 777 aa  109  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  42.95 
 
 		 1035 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  40.12 
 
 		 1931 aa  106  9e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  37.89 
 
 		 735 aa  102  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  35.05 
 
 		 595 aa  101  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  35.29 
 
 		 547 aa  100  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  42.38 
 
 		 375 aa  97.1  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  42.31 
 
 		 433 aa  94  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  32.03 
 
 		 1092 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  36.25 
 
 		 838 aa  93.6  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  28.7 
 
 		 352 aa  90.1  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  44.44 
 
 		 505 aa  90.1  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  32.86 
 
 		 810 aa  88.2  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  46.59 
 
 		 954 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  31.09 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  30.84 
 
 		 724 aa  84.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  33.83 
 
 		 620 aa  84  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  40.57 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  38.38 
 
 		 1056 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  33.93 
 
 		 698 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  29.48 
 
 		 570 aa  81.3  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  51.14 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  44 
 
 		 525 aa  80.9  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  35.26 
 
 		 697 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  34.91 
 
 		 709 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  50.72 
 
 		 919 aa  77.8  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  37.6 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2795  hypothetical protein  34.58 
 
 		 961 aa  73.9  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.827572  hitchhiker  0.0000678695 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  35.19 
 
 		 1328 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  35 
 
 		 749 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  26.61 
 
 		 341 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  33.03 
 
 		 1311 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  31.47 
 
 		 360 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  22.14 
 
 		 428 aa  66.6  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  28.77 
 
 		 1242 aa  66.2  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  22.35 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  22.35 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  30.5 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  40.82 
 
 		 302 aa  63.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  21.48 
 
 		 425 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  30.15 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  23.2 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.15 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  31.31 
 
 		 153 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  21.61 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  37.61 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  24.32 
 
 		 1332 aa  58.5  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  26.74 
 
 		 1200 aa  57.4  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  20.85 
 
 		 431 aa  57  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  20.85 
 
 		 431 aa  57  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  23.28 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  32.08 
 
 		 497 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  24.83 
 
 		 720 aa  54.7  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  29.95 
 
 		 899 aa  54.3  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  34.51 
 
 		 467 aa  53.5  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  22.35 
 
 		 400 aa  52.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0688  Fibronectin type III domain protein  34.29 
 
 		 513 aa  51.6  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  20.38 
 
 		 400 aa  51.2  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  21.1 
 
 		 416 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  21.19 
 
 		 400 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  21.1 
 
 		 416 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  21.99 
 
 		 431 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.72 
 
 		 510 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  30.69 
 
 		 648 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  22.44 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  20.86 
 
 		 416 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  39.53 
 
 		 2036 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  35.29 
 
 		 2272 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  38.37 
 
 		 1969 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  27.05 
 
 		 647 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  26.9 
 
 		 1755 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  37.1 
 
 		 671 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  19.92 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  25.83 
 
 		 446 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  23.21 
 
 		 441 aa  46.2  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  23.89 
 
 		 424 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.03 
 
 		 677 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  31.31 
 
 		 550 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.44 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  24.08 
 
 		 429 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  28.31 
 
 		 707 aa  44.3  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>