125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2143 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  100 
 
 		 638 aa  1265    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  33.5 
 
 		 641 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  34.18 
 
 		 570 aa  162  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.47 
 
 		 685 aa  144  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  35.51 
 
 		 352 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.55 
 
 		 458 aa  140  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  36.63 
 
 		 564 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  38.49 
 
 		 409 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  32.03 
 
 		 777 aa  124  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  32.52 
 
 		 1200 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  28.91 
 
 		 871 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  26.62 
 
 		 1931 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  36.24 
 
 		 471 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  31.9 
 
 		 500 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  32.97 
 
 		 341 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  37.02 
 
 		 302 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  38.74 
 
 		 735 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  42.33 
 
 		 810 aa  107  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  36.87 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  40.22 
 
 		 709 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  41.29 
 
 		 1001 aa  100  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  39.31 
 
 		 547 aa  99.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  32 
 
 		 510 aa  100  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  31.65 
 
 		 635 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.35 
 
 		 677 aa  96.7  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  34.94 
 
 		 960 aa  96.3  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1121 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  32.67 
 
 		 831 aa  95.1  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  24.66 
 
 		 647 aa  94.7  4e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  47.06 
 
 		 245 aa  94.7  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  38.28 
 
 		 505 aa  94.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  32.22 
 
 		 360 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  30.45 
 
 		 954 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  36.2 
 
 		 698 aa  90.1  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  31.75 
 
 		 940 aa  88.2  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  37.84 
 
 		 153 aa  88.2  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  37.93 
 
 		 461 aa  87.4  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  43.8 
 
 		 1092 aa  87  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  32 
 
 		 1035 aa  87  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  62.5 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  28.01 
 
 		 595 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  40.8 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  31.34 
 
 		 892 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  32.72 
 
 		 697 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  35 
 
 		 838 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  39.46 
 
 		 749 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  35.11 
 
 		 724 aa  79.7  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  28.48 
 
 		 805 aa  78.6  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  43.33 
 
 		 919 aa  76.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  29.93 
 
 		 820 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  26.4 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  35.38 
 
 		 1056 aa  73.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  26.99 
 
 		 501 aa  71.6  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  27.61 
 
 		 1025 aa  70.5  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  33.51 
 
 		 525 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  23.89 
 
 		 417 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  27.33 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  30.6 
 
 		 648 aa  67.4  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  26.26 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  44.44 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  26.69 
 
 		 707 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.61 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  32.77 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  27.37 
 
 		 410 aa  61.2  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  24.65 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  27.22 
 
 		 1628 aa  60.8  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  24.63 
 
 		 400 aa  60.8  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  24.42 
 
 		 400 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  31.74 
 
 		 620 aa  60.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  25.81 
 
 		 308 aa  60.1  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  24.1 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  24.1 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  24.41 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  24.41 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  22.37 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  26.85 
 
 		 406 aa  57  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  30.6 
 
 		 899 aa  56.6  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  28.34 
 
 		 483 aa  56.6  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  23.57 
 
 		 400 aa  55.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  27.24 
 
 		 405 aa  55.1  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  22.89 
 
 		 445 aa  54.7  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  25 
 
 		 863 aa  54.3  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.79 
 
 		 416 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  22.79 
 
 		 416 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  22.36 
 
 		 425 aa  53.9  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  22.71 
 
 		 443 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  31.48 
 
 		 172 aa  52.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  22.43 
 
 		 416 aa  52  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  27.37 
 
 		 418 aa  51.6  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.71 
 
 		 425 aa  52  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  24.04 
 
 		 423 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  25.39 
 
 		 972 aa  51.6  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  24.11 
 
 		 442 aa  50.8  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  23.31 
 
 		 451 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  28.18 
 
 		 582 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  22.31 
 
 		 505 aa  48.9  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  25.39 
 
 		 439 aa  48.9  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.43 
 
 		 458 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  26.52 
 
 		 457 aa  47.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.77 
 
 		 467 aa  47  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>