95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1727 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  100 
 
 
418 aa  845    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  69.44 
 
 
410 aa  571  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  58.56 
 
 
404 aa  472  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  48.96 
 
 
405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  43.37 
 
 
452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  38.12 
 
 
422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  35.48 
 
 
454 aa  249  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  37.22 
 
 
406 aa  249  9e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  29.92 
 
 
431 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  29.92 
 
 
431 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  31.1 
 
 
501 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  29.77 
 
 
425 aa  163  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  27.32 
 
 
423 aa  160  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  29.82 
 
 
417 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  29.77 
 
 
400 aa  159  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  30.33 
 
 
428 aa  159  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  27.5 
 
 
443 aa  152  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  29.05 
 
 
423 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  29.05 
 
 
423 aa  150  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.2 
 
 
459 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  29.23 
 
 
422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.23 
 
 
458 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.23 
 
 
458 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  28.27 
 
 
454 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  28.57 
 
 
439 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  28.39 
 
 
432 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  29.25 
 
 
454 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  28.22 
 
 
442 aa  135  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  28.24 
 
 
459 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  28.5 
 
 
445 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.01 
 
 
416 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  27.01 
 
 
416 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  27.34 
 
 
437 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  26.75 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  27.21 
 
 
400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  26.49 
 
 
416 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.06 
 
 
467 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.41 
 
 
425 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  27.27 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  28.12 
 
 
452 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  27.74 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  26.09 
 
 
503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  30.62 
 
 
429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  25.88 
 
 
462 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  27.47 
 
 
457 aa  120  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  25.23 
 
 
439 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  27.9 
 
 
441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  26.6 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.88 
 
 
464 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.88 
 
 
464 aa  113  7.000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  25.44 
 
 
451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  28.89 
 
 
446 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  28.93 
 
 
446 aa  108  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.52 
 
 
467 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  24.75 
 
 
428 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  24.16 
 
 
428 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  28.93 
 
 
439 aa  104  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  25.96 
 
 
633 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  29.22 
 
 
452 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  28.31 
 
 
422 aa  99  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  25.67 
 
 
431 aa  96.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.1 
 
 
425 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.76 
 
 
447 aa  92.4  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  25.87 
 
 
428 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  26.58 
 
 
429 aa  90.1  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  26.73 
 
 
424 aa  90.1  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  27.2 
 
 
429 aa  89.7  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.84 
 
 
424 aa  86.3  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  23.92 
 
 
431 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  28.37 
 
 
1200 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  22.89 
 
 
651 aa  73.2  0.000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  25.36 
 
 
352 aa  67.4  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.67 
 
 
510 aa  63.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  20.48 
 
 
638 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  26.07 
 
 
570 aa  56.6  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  32.89 
 
 
302 aa  53.9  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  30 
 
 
1092 aa  52.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  27.37 
 
 
638 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  26.86 
 
 
960 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  23.77 
 
 
1001 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  20.51 
 
 
672 aa  50.8  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  25.21 
 
 
871 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  23.44 
 
 
647 aa  47.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  26.47 
 
 
648 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  23.62 
 
 
711 aa  47.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  37.8 
 
 
172 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  28.99 
 
 
707 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  33.68 
 
 
844 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 
1121 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  36.76 
 
 
433 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.04 
 
 
685 aa  43.5  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  41.1 
 
 
525 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  28.65 
 
 
735 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  33.82 
 
 
550 aa  43.1  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  29.8 
 
 
360 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>