82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0351 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  100 
 
 
638 aa  1259    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  48.83 
 
 
711 aa  512  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  45.31 
 
 
672 aa  506  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  44.59 
 
 
651 aa  485  1e-135  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  44.83 
 
 
633 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  26.56 
 
 
437 aa  117  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  22.82 
 
 
441 aa  109  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  27.16 
 
 
439 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  29.15 
 
 
443 aa  108  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  25.78 
 
 
462 aa  107  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  28.68 
 
 
503 aa  106  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  24.19 
 
 
501 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  24.28 
 
 
439 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.39 
 
 
464 aa  104  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  26.39 
 
 
464 aa  104  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  26.21 
 
 
428 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  26.38 
 
 
428 aa  103  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  27.88 
 
 
454 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  26.15 
 
 
428 aa  100  6e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  24.59 
 
 
442 aa  99.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  28.68 
 
 
454 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  26.83 
 
 
451 aa  97.1  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  26.79 
 
 
431 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  26.79 
 
 
431 aa  95.9  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  26.48 
 
 
452 aa  94.4  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  21.71 
 
 
457 aa  93.2  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  27.78 
 
 
452 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  28.64 
 
 
400 aa  92  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  24.57 
 
 
446 aa  91.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  28.43 
 
 
416 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  28.43 
 
 
416 aa  91.3  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  28.68 
 
 
416 aa  90.9  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  25.62 
 
 
432 aa  90.5  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  28.64 
 
 
400 aa  90.5  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  26.38 
 
 
425 aa  89.7  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  23 
 
 
483 aa  89  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  26.72 
 
 
423 aa  87.8  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  25.97 
 
 
422 aa  87.4  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  24.88 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  25.49 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  24.88 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  24.44 
 
 
428 aa  84  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  26.5 
 
 
445 aa  83.2  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  26.98 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  23.76 
 
 
431 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.93 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26 
 
 
467 aa  79.7  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.48 
 
 
467 aa  79.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  24.04 
 
 
429 aa  79  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  24.76 
 
 
424 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  27.84 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  24.28 
 
 
429 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.52 
 
 
447 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  24.53 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  26.93 
 
 
454 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  23.89 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.68 
 
 
424 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  24.49 
 
 
462 aa  76.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  23.46 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  23.15 
 
 
429 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  20.05 
 
 
405 aa  72  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.06 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.01 
 
 
425 aa  70.5  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.75 
 
 
425 aa  68.6  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  21.98 
 
 
410 aa  67  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.15 
 
 
458 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  24.01 
 
 
422 aa  64.3  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  23.97 
 
 
1200 aa  64.3  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  21.43 
 
 
452 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  20.48 
 
 
418 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  21.56 
 
 
406 aa  59.7  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  20.53 
 
 
404 aa  57.8  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  26.52 
 
 
422 aa  57.8  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  22.17 
 
 
417 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  24.5 
 
 
1242 aa  53.9  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  29.41 
 
 
308 aa  47.8  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  20.36 
 
 
352 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.72 
 
 
510 aa  47.4  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  23.55 
 
 
884 aa  45.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0578  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.49 
 
 
364 aa  44.7  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.56022  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  30.11 
 
 
1092 aa  44.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  23.26 
 
 
882 aa  44.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>