98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_A0252 on replicon NC_009504
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  100 
 
 
464 aa  946    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  100 
 
 
464 aa  946    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  82.85 
 
 
462 aa  789    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  54.99 
 
 
451 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  59.11 
 
 
454 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  56.64 
 
 
452 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  52.4 
 
 
462 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  57.81 
 
 
454 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  50.94 
 
 
443 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  47.44 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  48.39 
 
 
445 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  42.33 
 
 
437 aa  335  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1737  nitrous oxide reductase maturation protein NosD  38.82 
 
 
428 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20190  copper ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  39.7 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00197549  normal  0.794755 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  35.68 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  39.09 
 
 
442 aa  304  3.0000000000000004e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3077  periplasmic copper-binding  38.83 
 
 
439 aa  302  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  36.26 
 
 
483 aa  295  1e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  36.05 
 
 
457 aa  291  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  35.65 
 
 
410 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  33.7 
 
 
467 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  35.93 
 
 
446 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  34.83 
 
 
432 aa  264  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  33.49 
 
 
439 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  32.65 
 
 
423 aa  249  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  32.65 
 
 
423 aa  249  6e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3870  periplasmic copper-binding  33.26 
 
 
428 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  31.86 
 
 
431 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  34.32 
 
 
429 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  31.86 
 
 
431 aa  247  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  34.59 
 
 
400 aa  246  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  32.88 
 
 
422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  34.75 
 
 
446 aa  243  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.46 
 
 
416 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  34.46 
 
 
416 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  34.19 
 
 
400 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  32.39 
 
 
425 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  34.22 
 
 
416 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  32.05 
 
 
423 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  31.81 
 
 
429 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  31.81 
 
 
431 aa  236  7e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  31.81 
 
 
424 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0495  periplasmic copper-binding  31.42 
 
 
429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0486  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  31.44 
 
 
424 aa  233  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  32.94 
 
 
447 aa  232  9e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  31.25 
 
 
428 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3995  periplasmic copper-binding  30.8 
 
 
431 aa  229  8e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  30.95 
 
 
400 aa  220  3e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  30.39 
 
 
503 aa  219  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  31.95 
 
 
452 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  28.76 
 
 
501 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.48 
 
 
467 aa  165  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  28.76 
 
 
454 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.53 
 
 
459 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  26.8 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.34 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.59 
 
 
458 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  27.21 
 
 
422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  28.87 
 
 
459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  26.93 
 
 
452 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  25.06 
 
 
410 aa  121  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  23.39 
 
 
405 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  24.88 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  21.95 
 
 
425 aa  107  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  26.55 
 
 
638 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.52 
 
 
425 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  22.9 
 
 
404 aa  102  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  22.88 
 
 
406 aa  100  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2966  copper-binding protein  25.33 
 
 
633 aa  89.4  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.58958  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  25.48 
 
 
1200 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  23.22 
 
 
672 aa  66.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  25.88 
 
 
648 aa  64.3  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  30.56 
 
 
308 aa  63.5  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  22.73 
 
 
711 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  21.9 
 
 
651 aa  60.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.51 
 
 
677 aa  60.1  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  26.61 
 
 
375 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  27.75 
 
 
707 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  22.75 
 
 
341 aa  56.6  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  21.23 
 
 
871 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0578  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.56 
 
 
364 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.56022  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  22.44 
 
 
595 aa  51.2  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  25.79 
 
 
1025 aa  50.4  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  29.41 
 
 
505 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  22.86 
 
 
471 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  30.2 
 
 
172 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1931  nitrous oxidase accessory protein-like protein  23.39 
 
 
422 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  25.41 
 
 
2036 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  25.21 
 
 
1969 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  34.07 
 
 
348 aa  47  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  27.42 
 
 
2272 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  24.18 
 
 
647 aa  46.6  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  25.76 
 
 
735 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  27.43 
 
 
641 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  26.4 
 
 
360 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  32.29 
 
 
505 aa  44.7  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  20.49 
 
 
638 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  32.94 
 
 
1332 aa  43.5  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>