126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0067 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  100 
 
 		 302 aa  589  1e-167  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  40.84 
 
 		 458 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  39.43 
 
 		 352 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  46.69 
 
 		 570 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  38.31 
 
 		 638 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  36.18 
 
 		 409 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  39.25 
 
 		 341 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  48.94 
 
 		 153 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  36.39 
 
 		 641 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  36.5 
 
 		 500 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  40.4 
 
 		 375 aa  116  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  37.35 
 
 		 1200 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  33.92 
 
 		 960 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  37.4 
 
 		 871 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  40.64 
 
 		 1001 aa  99  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  40.66 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  42.2 
 
 		 505 aa  94  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  37.38 
 
 		 471 aa  94.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.8 
 
 		 735 aa  93.2  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  34.22 
 
 		 635 aa  92.4  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  37.16 
 
 		 810 aa  87.4  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  41.04 
 
 		 525 aa  86.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  28.11 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  31.73 
 
 		 677 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  27.92 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.41 
 
 		 685 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  35.53 
 
 		 647 aa  73.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.75 
 
 		 510 aa  72  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  28.92 
 
 		 410 aa  70.5  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  29.32 
 
 		 405 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  23.78 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  26.13 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  35.56 
 
 		 831 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  22.93 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  22.18 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  29.8 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  29.38 
 
 		 707 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  32.22 
 
 		 940 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  21.37 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  21.37 
 
 		 416 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  28.12 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  22.3 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  22.3 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  27.54 
 
 		 501 aa  63.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  31.01 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  20.97 
 
 		 416 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  31.28 
 
 		 1092 aa  62.4  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0620  hypothetical protein  37.5 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.611979  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.71 
 
 		 2272 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  22.14 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  22.14 
 
 		 431 aa  58.9  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  29.07 
 
 		 406 aa  58.9  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 1056 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  30.2 
 
 		 2036 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0442  nitrous oxidase accessory protein  28.85 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.497509  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.13 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0412  Parallel beta-helix repeat protein  24.15 
 
 		 468 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  29.39 
 
 		 863 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  31.09 
 
 		 899 aa  57.4  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  25.31 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  20.96 
 
 		 422 aa  57  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  32.32 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  26.67 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  36.55 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  32.35 
 
 		 1969 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  24.17 
 
 		 439 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  29.8 
 
 		 547 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  35.85 
 
 		 1025 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  20.64 
 
 		 423 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  28.19 
 
 		 892 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  21.38 
 
 		 425 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  25.98 
 
 		 442 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  20.56 
 
 		 400 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  22.39 
 
 		 443 aa  53.5  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.33 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0648  Fibronectin type III domain protein  39.58 
 
 		 972 aa  53.5  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25 
 
 		 425 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 1121 aa  52.8  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  25.49 
 
 		 451 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  35.43 
 
 		 297 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  23.28 
 
 		 674 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  23.97 
 
 		 428 aa  51.6  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.75 
 
 		 467 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2565  hypothetical protein  26.96 
 
 		 464 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041673 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  34.9 
 
 		 820 aa  51.2  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  32.73 
 
 		 1628 aa  51.6  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  23.98 
 
 		 454 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1163  periplasmic copper-binding  24.37 
 
 		 503 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.309435 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  20.89 
 
 		 445 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  27.3 
 
 		 805 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  29.63 
 
 		 595 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.7 
 
 		 447 aa  49.7  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  19.28 
 
 		 459 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  21.46 
 
 		 432 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  22.03 
 
 		 462 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  23.92 
 
 		 439 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  21.67 
 
 		 651 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  20.48 
 
 		 459 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  25.09 
 
 		 768 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  18.88 
 
 		 458 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>