94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0847 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  100 
 
 		 172 aa  349  8e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  46.72 
 
 		 1200 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  39.86 
 
 		 707 aa  97.8  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  34.31 
 
 		 308 aa  92  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  40.44 
 
 		 899 aa  87.4  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  41.18 
 
 		 648 aa  86.7  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  35.14 
 
 		 501 aa  85.5  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  34.46 
 
 		 677 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  42.54 
 
 		 550 aa  82  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  35.04 
 
 		 454 aa  79  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  41.32 
 
 		 2272 aa  72.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  29.69 
 
 		 352 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  35.85 
 
 		 409 aa  64.7  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  36.97 
 
 		 2036 aa  63.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  36.97 
 
 		 1969 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  37.14 
 
 		 1092 aa  61.6  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  31.98 
 
 		 570 aa  61.6  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  32.3 
 
 		 458 aa  61.2  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1001 aa  60.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  30.43 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  31.45 
 
 		 439 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  31.65 
 
 		 671 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4218  periplasmic copper-binding  31.82 
 
 		 443 aa  58.9  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  32.09 
 
 		 360 aa  58.2  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  31.03 
 
 		 451 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  29.41 
 
 		 1732 aa  57.4  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  35.19 
 
 		 302 aa  57  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  33.88 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  35.34 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  33.88 
 
 		 431 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  36.22 
 
 		 810 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  41.98 
 
 		 400 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  41.98 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  41.98 
 
 		 416 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  41.89 
 
 		 428 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  35.65 
 
 		 445 aa  54.3  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  31.33 
 
 		 462 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  40.74 
 
 		 416 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  41.98 
 
 		 400 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  29.53 
 
 		 422 aa  53.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  37.23 
 
 		 500 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  37.65 
 
 		 400 aa  53.1  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  31.48 
 
 		 638 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0007  nitrous oxidase accessory protein  34.62 
 
 		 410 aa  52  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189089  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  29.03 
 
 		 341 aa  52  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  30 
 
 		 423 aa  51.6  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.78 
 
 		 467 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  29.17 
 
 		 425 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4470  periplasmic copper-binding  26.24 
 
 		 446 aa  49.7  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  27.78 
 
 		 458 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  31.07 
 
 		 547 aa  49.7  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  31.16 
 
 		 647 aa  49.3  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  30.56 
 
 		 735 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  32.76 
 
 		 464 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  32.76 
 
 		 464 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  28.49 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0355  periplasmic copper-binding  33.63 
 
 		 452 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  28.97 
 
 		 457 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  35.37 
 
 		 510 aa  48.5  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  29.85 
 
 		 1750 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1300  periplasmic copper-binding  31.94 
 
 		 405 aa  48.1  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.057669  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  28.76 
 
 		 462 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  28.57 
 
 		 467 aa  47.8  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  32.41 
 
 		 437 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.95 
 
 		 458 aa  47.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  26.53 
 
 		 441 aa  47.4  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1727  nitrous oxidase accessory protein  37.8 
 
 		 418 aa  47.4  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.174629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  33.72 
 
 		 422 aa  47  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0486  periplasmic copper-binding  29.46 
 
 		 446 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  30.33 
 
 		 406 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  25 
 
 		 454 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1567  periplasmic copper-binding  29.46 
 
 		 452 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0198454  normal  0.645907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 423 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  26.99 
 
 		 960 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2352  periplasmic copper-binding  31.86 
 
 		 454 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 		 423 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  30.08 
 
 		 509 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2565  hypothetical protein  37.84 
 
 		 464 aa  45.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041673 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  26.83 
 
 		 400 aa  44.7  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  34.12 
 
 		 432 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  35.62 
 
 		 442 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  23.81 
 
 		 459 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  31.48 
 
 		 483 aa  43.9  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0489  periplasmic copper-binding  29.91 
 
 		 410 aa  44.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.4 
 
 		 459 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0976  hypothetical protein  28.44 
 
 		 844 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.495512  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0500  periplasmic copper-binding  31.25 
 
 		 429 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  27.42 
 
 		 439 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  42.59 
 
 		 3295 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  26.88 
 
 		 871 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3359  periplasmic copper-binding  32.43 
 
 		 431 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.988471  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4449  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.84 
 
 		 447 aa  42  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0099  hypothetical protein  29.89 
 
 		 520 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0361  hypothetical protein  32.95 
 
 		 485 aa  41.2  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>