22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1378 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  802    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  47.68 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  44.71 
 
 		 413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  46.73 
 
 		 413 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  46.73 
 
 		 413 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  44.77 
 
 		 411 aa  273  4.0000000000000004e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  45.05 
 
 		 402 aa  260  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  39.43 
 
 		 907 aa  210  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  39.43 
 
 		 911 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  39.43 
 
 		 911 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  39.14 
 
 		 911 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  38.38 
 
 		 883 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  39.43 
 
 		 880 aa  206  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  38.53 
 
 		 882 aa  206  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  39.09 
 
 		 884 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.18 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  36.94 
 
 		 768 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  32.01 
 
 		 509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  28.57 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.84 
 
 		 677 aa  47.8  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  23.63 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  26.83 
 
 		 172 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>