22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2801 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  95.4 
 
 
413 aa  763    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 
413 aa  817    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  99.76 
 
 
413 aa  816    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  42 
 
 
411 aa  277  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  42.44 
 
 
402 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  42.82 
 
 
415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  46.73 
 
 
400 aa  274  3e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  36.74 
 
 
423 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  39.47 
 
 
882 aa  223  6e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  38.29 
 
 
911 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  38.89 
 
 
907 aa  219  5e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  38.29 
 
 
911 aa  219  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  38.3 
 
 
911 aa  218  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  35.61 
 
 
883 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  35.52 
 
 
880 aa  216  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  36.02 
 
 
884 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.07 
 
 
768 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  33.1 
 
 
509 aa  123  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  25.8 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  27.5 
 
 
427 aa  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  34 
 
 
651 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  23.18 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>