35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2283 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  852    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  32.43 
 
 
453 aa  110  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  27.73 
 
 
509 aa  90.9  4e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.95 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  28.57 
 
 
768 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  26.44 
 
 
880 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  28.29 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  26.9 
 
 
883 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  26.88 
 
 
882 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2594  hypothetical protein  26.97 
 
 
683 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.397172 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  25.88 
 
 
884 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  28.57 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.33 
 
 
423 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  26.35 
 
 
911 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  26.05 
 
 
911 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  25.75 
 
 
911 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  25.5 
 
 
907 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.03 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  27.62 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  26.06 
 
 
413 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  28.19 
 
 
402 aa  50.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1165  poly(beta-D-mannuronate) lyase  24.64 
 
 
581 aa  50.4  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.701622  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0354  hypothetical protein  38.36 
 
 
536 aa  50.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332519 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  30.11 
 
 
871 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  28.17 
 
 
525 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  26.43 
 
 
348 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  19 
 
 
471 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  36.07 
 
 
863 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2565  hypothetical protein  31.31 
 
 
464 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000041673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1299  putative lipoprotein  30.05 
 
 
445 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000621039  hitchhiker  0.00401403 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  38.36 
 
 
899 aa  44.3  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  22.59 
 
 
458 aa  44.3  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  40.74 
 
 
960 aa  43.5  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  35.29 
 
 
647 aa  43.5  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  23.53 
 
 
409 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>