20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1644 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 
423 aa  843    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  48.89 
 
 
411 aa  388  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  45.52 
 
 
415 aa  345  7e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.12 
 
 
413 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  38.55 
 
 
413 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  38.55 
 
 
413 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  34.55 
 
 
402 aa  210  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  36.18 
 
 
400 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  31.45 
 
 
883 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  32.94 
 
 
911 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  32.94 
 
 
911 aa  171  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  32.05 
 
 
882 aa  170  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  32.64 
 
 
911 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  31.93 
 
 
907 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  32.05 
 
 
884 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  31.16 
 
 
880 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  31.58 
 
 
768 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  28.57 
 
 
509 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  26.33 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  23.12 
 
 
638 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>