30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3272 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 
402 aa  822    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  44.47 
 
 
415 aa  281  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  41.62 
 
 
413 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  41.62 
 
 
413 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.88 
 
 
413 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  45.05 
 
 
400 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.11 
 
 
411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  40.74 
 
 
907 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  40.23 
 
 
911 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  40.23 
 
 
911 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  38.54 
 
 
880 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  38.96 
 
 
883 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  39.94 
 
 
911 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  38.87 
 
 
882 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  41.71 
 
 
884 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  33.74 
 
 
423 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  33.69 
 
 
768 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  33.21 
 
 
509 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2594  hypothetical protein  23.53 
 
 
683 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.397172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  25.1 
 
 
453 aa  54.3  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  28.8 
 
 
427 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  22.34 
 
 
348 aa  50.8  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1126  hypothetical protein  26.85 
 
 
657 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1125  hypothetical protein  26.85 
 
 
657 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.837381  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1124  hypothetical protein  26.63 
 
 
868 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2979  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.86 
 
 
541 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.461822  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  27.21 
 
 
672 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  24.03 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  23.87 
 
 
431 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  23.87 
 
 
431 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>