25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2620 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2620  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 
413 aa  818    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2801  parallel beta-helix repeat protein  95.4 
 
 
413 aa  764    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2706  parallel beta-helix repeat protein  95.64 
 
 
413 aa  766    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1979  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.04 
 
 
411 aa  283  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1378  hypothetical protein  42.96 
 
 
400 aa  275  9e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.895761  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0653  hypothetical protein  43.09 
 
 
415 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000140192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3272  Parallel beta-helix repeat protein  42.71 
 
 
402 aa  273  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1644  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.12 
 
 
423 aa  225  9e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.202542  normal  0.498245 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2116  hypothetical protein  38.19 
 
 
882 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2930  hypothetical protein  37.16 
 
 
907 aa  218  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1539  hypothetical protein  37.34 
 
 
911 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.57335  hitchhiker  0.0040034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1474  hypothetical protein  37.34 
 
 
911 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115703  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2404  hypothetical protein  35.34 
 
 
883 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.647298  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1533  hypothetical protein  37.34 
 
 
911 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000671911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2900  hypothetical protein  35.57 
 
 
880 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000339287  hitchhiker  0.00411804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1658  hypothetical protein  35.34 
 
 
884 aa  209  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  34.77 
 
 
768 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1106  hypothetical protein  33.45 
 
 
509 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.875896 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  27.03 
 
 
427 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  26.36 
 
 
348 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3553  hypothetical protein  23.18 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56274  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2677  NosL family protein  34 
 
 
651 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2594  hypothetical protein  22.77 
 
 
683 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.397172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1778  hypothetical protein  26.58 
 
 
626 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294747  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 
804 aa  43.5  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>