19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2565 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2565  hypothetical protein  100 
 
 		 464 aa  954    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041673 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0361  hypothetical protein  35.39 
 
 		 485 aa  223  8e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 550 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  25.13 
 
 		 1200 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  25.87 
 
 		 153 aa  51.6  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2297  putative signal peptide protein  36.84 
 
 		 2742 aa  50.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.992598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  25.7 
 
 		 635 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  30.2 
 
 		 302 aa  48.5  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4658  Cytochrome-c peroxidase  42.25 
 
 		 768 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  26.77 
 
 		 871 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  37.84 
 
 		 172 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4700  hypothetical protein  33.04 
 
 		 2698 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.709916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  25.57 
 
 		 1092 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  26.9 
 
 		 552 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 		 674 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2283  hypothetical protein  31.31 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.275033 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3195  nitrous oxide maturation protein  23.2 
 
 		 445 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.472641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  30.29 
 
 		 400 aa  43.5  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4438  Pectinesterase  45.45 
 
 		 391 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0674523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>