91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0333 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  100 
 
 
308 aa  612  9.999999999999999e-175  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1626  periplasmic copper-binding  36.69 
 
 
899 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0959099  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1643  cell surface protein  35.84 
 
 
1200 aa  104  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  31.29 
 
 
707 aa  99.4  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0847  cell surface protein  34.31 
 
 
172 aa  92  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0211  periplasmic copper-binding  28.06 
 
 
501 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.889155  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  31.18 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0322  periplasmic copper-binding  29.53 
 
 
648 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0296  hypothetical protein  29.59 
 
 
550 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.790806  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.67 
 
 
735 aa  73.9  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  29.73 
 
 
677 aa  73.2  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  30.2 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  27.57 
 
 
375 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  29.61 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1391  nitrous oxidase accessory protein  27.72 
 
 
422 aa  65.9  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0750  protein kinase  31.88 
 
 
671 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0831444  normal  0.845491 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2218  periplasmic copper-binding  26.32 
 
 
483 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1463  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.77 
 
 
458 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  28.65 
 
 
360 aa  63.5  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1558  Carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  28.77 
 
 
458 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141608  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  29.44 
 
 
400 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2324  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  32.59 
 
 
400 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.361352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  26.89 
 
 
570 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  27.73 
 
 
871 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  34.1 
 
 
505 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  25.81 
 
 
638 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.55 
 
 
458 aa  59.7  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  27.33 
 
 
1092 aa  59.3  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  24.36 
 
 
352 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  28.57 
 
 
2036 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  26.19 
 
 
1969 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2014  periplasmic copper-binding protein  29.03 
 
 
454 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  26.73 
 
 
467 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.86 
 
 
685 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  28.71 
 
 
547 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1427  transcriptional regulator for copper, periplasmic binding protein, LacI family protein  26.96 
 
 
441 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  29.01 
 
 
416 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  26.18 
 
 
500 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  29.01 
 
 
416 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  29.01 
 
 
416 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0252  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  32.08 
 
 
464 aa  55.8  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0276  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  32.08 
 
 
464 aa  55.8  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.189297  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1137  periplasmic copper-binding  26.67 
 
 
423 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0889147  normal  0.932026 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0239  cell surface protein  31.03 
 
 
153 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00514923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0246  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.09 
 
 
459 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.279871  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1058  periplasmic copper-binding  26.67 
 
 
423 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  25.57 
 
 
454 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0510  periplasmic copper-binding  25.84 
 
 
439 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2565  periplasmic copper-binding  25.77 
 
 
437 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.156949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2400  periplasmic copper-binding, NosD  27.03 
 
 
459 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  29.41 
 
 
940 aa  52.8  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0661  periplasmic copper-binding  26.72 
 
 
428 aa  52.4  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.564109  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  26.86 
 
 
620 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  27.91 
 
 
471 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.07 
 
 
2272 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  28.68 
 
 
647 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  31.52 
 
 
1628 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  30.7 
 
 
1332 aa  50.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4733  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  25.23 
 
 
467 aa  50.8  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1370  copper-binding periplasmic NOSD signal peptide protein  23.96 
 
 
423 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.13 
 
 
510 aa  50.1  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1075  periplasmic copper-binding  29.7 
 
 
442 aa  50.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1481  periplasmic copper-binding  22.76 
 
 
400 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.194727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4915  putative periplasmic copper-binding precursor  26.04 
 
 
425 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142909 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4345  periplasmic copper-binding  30.07 
 
 
462 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0351  copper-binding protein  29.41 
 
 
638 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.278001 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  27.52 
 
 
1001 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  25.68 
 
 
452 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4173  periplasmic copper-binding  25.77 
 
 
431 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4061  periplasmic copper-binding  25.77 
 
 
431 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0898621  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  25.49 
 
 
1931 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  29.44 
 
 
635 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  28.91 
 
 
810 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2860  periplasmic copper-binding  24.14 
 
 
451 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.837976  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.8 
 
 
1121 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3401  periplasmic copper-binding  25.79 
 
 
457 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000011758  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0067  cell surface protein  37.93 
 
 
302 aa  46.2  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  29.1 
 
 
641 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1213  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.04 
 
 
425 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0704016  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  26.67 
 
 
439 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1022  hypothetical protein  32.87 
 
 
382 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.45 
 
 
1829 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0688  Fibronectin type III domain protein  28.85 
 
 
513 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  29.2 
 
 
461 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0496  periplasmic copper-binding  24.67 
 
 
424 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  22.75 
 
 
425 aa  43.5  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3535  periplasmic copper-binding protein  24.67 
 
 
429 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0791  NosL family protein  31.82 
 
 
672 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0886  hypothetical protein  53.33 
 
 
208 aa  43.1  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  27.14 
 
 
595 aa  42.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3200  periplasmic copper-binding  30.3 
 
 
432 aa  42.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>