43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1803 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 594 aa  1162    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.92 
 
 		 677 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  36.08 
 
 		 595 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  28.61 
 
 		 638 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  44.19 
 
 		 1035 aa  58.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  31.11 
 
 		 1610 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  31.67 
 
 		 1610 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0787  nitrous oxidase accessory protein-like  27.93 
 
 		 647 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0695  periplasmic copper-binding  24.14 
 
 		 417 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.16971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  30.3 
 
 		 406 aa  52  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  31.19 
 
 		 874 aa  51.2  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.46 
 
 		 510 aa  50.8  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  33.66 
 
 		 724 aa  50.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0279  parallel beta-helix repeat-containing protein  31.06 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  27.86 
 
 		 1242 aa  49.7  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  22.96 
 
 		 871 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  25.78 
 
 		 1931 aa  48.5  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  28.57 
 
 		 424 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  31.58 
 
 		 505 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  36.84 
 
 		 1056 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0994  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein, putative  24.18 
 
 		 416 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.213533  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  31.25 
 
 		 892 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0240  hypothetical protein  30.14 
 
 		 215 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2243  nitrous oxidase accessory protein  30.07 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.685019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2116  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.18 
 
 		 416 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2061  copper ABC transporter, periplasmic copper-binding protein  24.18 
 
 		 416 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.465358  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2256  NosD  24.18 
 
 		 400 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1829 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2754  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  27.49 
 
 		 341 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00332846  hitchhiker  0.00111806 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1805  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  25.27 
 
 		 467 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.133966  normal  0.22274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7282  hypothetical protein  28.08 
 
 		 867 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.827215  normal  0.313024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1970  protein kinase  30.82 
 
 		 707 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.664592 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3320  hypothetical protein  24.47 
 
 		 439 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11516  normal  0.143363 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0669  cell surfacr protein  32.31 
 
 		 570 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00389799  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0046  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  33.54 
 
 		 685 aa  45.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0357051  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  35.21 
 
 		 831 aa  45.4  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  26.8 
 
 		 940 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  28.57 
 
 		 409 aa  45.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  26.69 
 
 		 1025 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  28.46 
 
 		 838 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5553  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  24.72 
 
 		 425 aa  43.9  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.564667  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2513  hypothetical protein  31.5 
 
 		 360 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.373892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0955  carbohydrate binding and sugar hydrolysis  37.35 
 
 		 523 aa  43.5  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.21055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>