16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0240 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0240  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0597  hypothetical protein  85.62 
 
 		 161 aa  274  7e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0487  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.93 
 
 		 254 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0596  hypothetical protein  45.86 
 
 		 304 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.743466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1421  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.68 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.670143  normal  0.74275 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.48 
 
 		 230 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  28.65 
 
 		 595 aa  50.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  31.25 
 
 		 1931 aa  50.1  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  31.08 
 
 		 1035 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3372  cell surface protein  35.05 
 
 		 352 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00468301  hitchhiker  0.00958354 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1803  parallel beta-helix repeat-containing protein  30.14 
 
 		 594 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0567689  unclonable  0.00000000968755 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3630  cell surface glycoprotein (S-layer protein)  29.07 
 
 		 500 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  28.38 
 
 		 1056 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  28.82 
 
 		 777 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  32.39 
 
 		 892 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  30.67 
 
 		 749 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>