20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1421 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1421  parallel beta-helix repeat-containing protein  100 
 
 		 255 aa  498  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.670143  normal  0.74275 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0487  parallel beta-helix repeat-containing protein  81.03 
 
 		 254 aa  402  1e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.33 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0596  hypothetical protein  47.44 
 
 		 304 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.743466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0240  hypothetical protein  40.84 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.63 
 
 		 510 aa  58.9  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0803  hypothetical protein  39.36 
 
 		 427 aa  53.1  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  25.76 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3733  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.45 
 
 		 379 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00966756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0597  hypothetical protein  27.84 
 
 		 161 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  28.11 
 
 		 831 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  29.36 
 
 		 777 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  31.13 
 
 		 595 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  33.86 
 
 		 720 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1121 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  24.58 
 
 		 709 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  26.76 
 
 		 698 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  26.88 
 
 		 1931 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  29.03 
 
 		 838 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.68 
 
 		 614 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>