102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1037 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  100 
 
 
614 aa  1242    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6338  alpha/beta hydrolase fold protein  34.67 
 
 
339 aa  135  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2553  alpha/beta hydrolase fold  45.3 
 
 
354 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.988163  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  28.94 
 
 
595 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0450  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 
332 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1468  Alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
311 aa  89.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1853  alpha/beta hydrolase fold  40.37 
 
 
354 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2684  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
310 aa  89  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000788491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8760  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
330 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0296  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 
304 aa  89  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.339788  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3547  alpha/beta hydrolase fold protein  40.83 
 
 
463 aa  87.4  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0967  periplasmic copper-binding  25.52 
 
 
720 aa  82.8  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.118197  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2298  hydrolase  37.5 
 
 
246 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2380  hypothetical protein  36.54 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2337  hypothetical protein  36.54 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000523507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2557  hypothetical protein  36.54 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.603556  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2570  hypothetical protein  36.54 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000316056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4312  alpha/beta hydrolase fold  39.82 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.312071  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1501  alpha/beta hydrolase fold  24.03 
 
 
340 aa  80.5  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2559  hypothetical protein  37.5 
 
 
246 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0317158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0448  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 
326 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.868263  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1044  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 
335 aa  78.6  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0219  YqjL  35.85 
 
 
145 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0610  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
323 aa  77.4  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  29.58 
 
 
954 aa  76.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  29.75 
 
 
724 aa  73.9  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  31.38 
 
 
461 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0414  alpha/beta hydrolase fold protein  36.09 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  26.94 
 
 
1931 aa  70.9  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  28.11 
 
 
919 aa  69.7  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2495  alpha/beta fold family hydrolase  22.11 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  25.33 
 
 
1056 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2201  alpha/beta fold family hydrolase  23.55 
 
 
327 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0899  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.21515 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  29.31 
 
 
433 aa  67.8  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  29.48 
 
 
749 aa  66.6  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1121 aa  65.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  29.41 
 
 
1035 aa  66.2  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0853  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
454 aa  65.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.577102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2903  alpha/beta hydrolase fold  38.79 
 
 
522 aa  65.5  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  26.58 
 
 
698 aa  65.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3579  hydrolase, alpha/beta fold family  22.41 
 
 
310 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  25.48 
 
 
697 aa  65.1  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25500  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.68 
 
 
294 aa  64.3  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0257089  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6083  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
326 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0861444 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  33.33 
 
 
838 aa  60.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.93 
 
 
746 aa  59.3  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0723  alpha/beta hydrolase fold  21.51 
 
 
268 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1621  alpha/beta hydrolase fold  23.29 
 
 
298 aa  58.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 
296 aa  58.5  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1797  hydrolase, alpha/beta fold family  21.8 
 
 
286 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1621  alpha/beta fold family hydrolase  22.15 
 
 
286 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1582  alpha/beta fold family hydrolase  21.8 
 
 
295 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00385289  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0682  Alpha/beta hydrolase  29.25 
 
 
392 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.904983  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1747  alpha/beta fold family hydrolase  22.15 
 
 
286 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1763  hydrolase, alpha/beta fold family  21.23 
 
 
298 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3733  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.57 
 
 
379 aa  54.3  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00966756  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1802  hypothetical protein  30.33 
 
 
424 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0194967  unclonable  0.00000000902281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1878  hydrolase, alpha/beta fold family  22.06 
 
 
278 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1573  alpha/beta fold family hydrolase  21.03 
 
 
286 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3309  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 
343 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.911918  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  25.96 
 
 
777 aa  53.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  31.19 
 
 
810 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7352  Alpha/beta hydrolase  29.2 
 
 
291 aa  50.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.253072 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  24.3 
 
 
892 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  25.59 
 
 
467 aa  50.8  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  30.47 
 
 
620 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1510  periplasmic copper-binding  25.37 
 
 
505 aa  49.7  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.163469  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3133  hypothetical protein  33 
 
 
623 aa  49.3  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.717287  normal  0.669821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2396  transcriptional regulator, LuxR family  27.73 
 
 
363 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000296074  decreased coverage  0.0001884 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
302 aa  48.9  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  22.84 
 
 
805 aa  47.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2766  cell surface protein  25.86 
 
 
409 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1824  alpha/beta fold family hydrolase  20.85 
 
 
278 aa  47  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.239343  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  26.19 
 
 
638 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  28.27 
 
 
641 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1206  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.28 
 
 
677 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  23.15 
 
 
831 aa  47  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
297 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  24 
 
 
709 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2660  hypothetical protein  23.94 
 
 
479 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00294  mitochondrial integral membrane protein (AFU_orthologue; AFUA_1G03090)  30.63 
 
 
522 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.185522 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0803  hypothetical protein  22.12 
 
 
347 aa  45.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  28.93 
 
 
294 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29690  hypothetical protein  25 
 
 
348 aa  45.8  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388142  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3510  hypothetical protein  27.34 
 
 
329 aa  45.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.367697  normal  0.875172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0434  Serine/threonine protein kinase  26.72 
 
 
674 aa  45.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000341904  normal  0.409693 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  23.21 
 
 
820 aa  45.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0679  hypothetical protein  22.22 
 
 
343 aa  44.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4655  alpha/beta hydrolase fold protein  32.32 
 
 
305 aa  44.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2854  hypothetical protein  23.62 
 
 
330 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  31.9 
 
 
299 aa  44.7  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3068  hypothetical protein  23.62 
 
 
330 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0882  hypothetical protein  26.09 
 
 
276 aa  44.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  32.46 
 
 
312 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1334  periplasmic copper-binding protein  26.24 
 
 
1025 aa  44.3  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.108389  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
437 aa  44.3  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2826  hypothetical protein  23.62 
 
 
328 aa  43.9  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0152162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2786  hypothetical protein  24.62 
 
 
328 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2095  putative hydrolase  31.1 
 
 
299 aa  43.9  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000308959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>