13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0596 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0596  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.743466  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0487  parallel beta-helix repeat-containing protein  43.93 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1421  parallel beta-helix repeat-containing protein  46.05 
 
 		 255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.670143  normal  0.74275 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1661  parallel beta-helix repeat-containing protein  45 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.98661  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0240  hypothetical protein  45.86 
 
 		 215 aa  85.9  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  29.3 
 
 		 810 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  26.82 
 
 		 595 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  25.89 
 
 		 697 aa  47  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  25.54 
 
 		 641 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  29.61 
 
 		 461 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  36.54 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  28.19 
 
 		 777 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  28.44 
 
 		 749 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>