61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2289 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1266    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  30.88 
 
 		 1931 aa  106  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1838  Carbohydrate binding family 6  30.29 
 
 		 1035 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.533489  normal  0.441295 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  31.48 
 
 		 749 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0686  periplasmic copper-binding  31.58 
 
 		 461 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.241556 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1008  periplasmic copper-binding  27.3 
 
 		 698 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1434  cell surface protein  30.97 
 
 		 375 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.195558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1007  periplasmic copper-binding  26.73 
 
 		 697 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.525995  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  25 
 
 		 838 aa  84.7  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3393  cell surface protein  33.83 
 
 		 564 aa  84  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.591831  normal  0.211217 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1833  periplasmic copper-binding  36.94 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107364 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  26.85 
 
 		 777 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  32.72 
 
 		 831 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  27.08 
 
 		 810 aa  77.4  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  30.24 
 
 		 724 aa  77  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  30.8 
 
 		 547 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2633  cell surface protein  34.87 
 
 		 245 aa  72.4  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.186167 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1397  periplasmic copper-binding  31.88 
 
 		 805 aa  70.5  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.80525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1344  periplasmic copper-binding  30.77 
 
 		 954 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.283677  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  33.94 
 
 		 1121 aa  68.6  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  32.61 
 
 		 1056 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  23.23 
 
 		 709 aa  67.4  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2454  hypothetical protein  32.19 
 
 		 467 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.471508 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.64 
 
 		 1454 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1001 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  30.74 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1279  periplasmic copper-binding  32.3 
 
 		 892 aa  64.7  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  27.31 
 
 		 940 aa  64.3  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2930  cell surface protein  34.15 
 
 		 641 aa  64.3  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0160224  hitchhiker  0.00346339 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  30.12 
 
 		 919 aa  63.9  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0498  APHP  29.84 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0698574  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  31.68 
 
 		 820 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0947  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.33 
 
 		 746 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172649  normal  0.261611 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.58 
 
 		 735 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0060  periplasmic copper-binding  29.86 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0894  periplasmic copper-binding  26.18 
 
 		 433 aa  60.1  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2670  hypothetical protein  29.95 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.734137  normal  0.611525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.48 
 
 		 953 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  28.82 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  30.84 
 
 		 6109 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  24.72 
 
 		 1092 aa  57  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  28.97 
 
 		 2030 aa  55.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.1 
 
 		 1726 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1684  cell surface glycoprotein  31.79 
 
 		 871 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.255762  normal  0.152599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  32.32 
 
 		 2632 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0333  cell surface glycoprotein (s-layer protein)  26.86 
 
 		 308 aa  52.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000130039  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2325  APHP  30 
 
 		 290 aa  52.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.58 
 
 		 627 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  25.47 
 
 		 1748 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1037  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.47 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2569  surface layer protein B  33.33 
 
 		 505 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.390258  normal  0.0285129 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  26.42 
 
 		 1613 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  41.86 
 
 		 960 aa  48.1  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  27.69 
 
 		 1332 aa  48.1  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2143  cell surface protein  27.88 
 
 		 638 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0254077  normal  0.694951 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1527  surface layer protein B  29.1 
 
 		 297 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  28.7 
 
 		 405 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1936  APHP domain protein  27.83 
 
 		 1074 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620471  normal  0.229187 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1273  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.14 
 
 		 510 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.429071  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1026  periplasmic copper-binding  31.52 
 
 		 406 aa  44.7  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04725  Subtilase family protein  30.3 
 
 		 145 aa  43.9  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>