60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1865 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  100 
 
 
640 aa  1231    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  45.28 
 
 
14609 aa  138  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  39.19 
 
 
1394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  40.17 
 
 
692 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  37.12 
 
 
462 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  38.05 
 
 
1831 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  51.61 
 
 
476 aa  98.6  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  44.56 
 
 
1316 aa  95.1  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2437  hypothetical protein  52.7 
 
 
469 aa  88.2  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3002  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  44.71 
 
 
248 aa  84  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  35.82 
 
 
1188 aa  82.4  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  39.16 
 
 
3861 aa  79.7  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  55.38 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0464  hypothetical protein  46.67 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00621297  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  50.89 
 
 
1487 aa  77.8  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5171  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  47.22 
 
 
168 aa  77.8  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  37.5 
 
 
4357 aa  77.4  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2548  hypothetical protein  47.95 
 
 
389 aa  77  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.140695 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  39.72 
 
 
3822 aa  76.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  36.97 
 
 
830 aa  77  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  40 
 
 
474 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  47.48 
 
 
767 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  37.12 
 
 
1908 aa  75.9  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2512  membrane protein  46.67 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  36.11 
 
 
261 aa  73.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  29.81 
 
 
4009 aa  71.2  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  30.13 
 
 
4022 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1271  hypothetical protein  53.23 
 
 
380 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.486206 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0766  hypothetical protein  39.58 
 
 
440 aa  69.3  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305198  normal  0.716911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1142  hypothetical protein  35.83 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0332  hypothetical protein  39.58 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0388  hypothetical protein  52.11 
 
 
435 aa  68.2  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3340  hypothetical protein  51.61 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1427  hypothetical protein  50 
 
 
444 aa  65.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  37.21 
 
 
3907 aa  64.7  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3612  hypothetical protein  37.36 
 
 
388 aa  63.9  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  54.05 
 
 
866 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  49.37 
 
 
3027 aa  61.2  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  43.07 
 
 
1332 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1765  hypothetical protein  36.92 
 
 
443 aa  57.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  48.24 
 
 
654 aa  57  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  51.43 
 
 
1107 aa  57.4  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0036  von Willebrand factor type A  35.19 
 
 
1446 aa  56.6  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2917  hypothetical protein  43.48 
 
 
527 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000178577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  37.17 
 
 
286 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  40.6 
 
 
496 aa  51.6  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  38.2 
 
 
453 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1236  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 
453 aa  47.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.149898  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  36.3 
 
 
780 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1400  regulatory protein MarR  39.02 
 
 
452 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  47.89 
 
 
2031 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3625  hypothetical protein  60 
 
 
442 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000590004 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3362  hypothetical protein  40.78 
 
 
365 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  42.86 
 
 
2117 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1389  hypothetical protein  39.24 
 
 
453 aa  45.4  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  30.77 
 
 
722 aa  44.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0462  hypothetical protein  36.84 
 
 
618 aa  44.7  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271828  normal  0.328949 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2831  hypothetical protein  30.43 
 
 
202 aa  43.9  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2392  hypothetical protein  29.13 
 
 
682 aa  43.9  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  37.74 
 
 
327 aa  43.9  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>