29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3625 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  884    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000590004 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  48.48 
 
 		 3027 aa  69.3  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  55.38 
 
 		 1107 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  53.97 
 
 		 14609 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  39.5 
 
 		 1316 aa  65.5  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  50.77 
 
 		 767 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  50 
 
 		 692 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  50 
 
 		 1831 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  58.73 
 
 		 1394 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2574  LamG domain-containing protein  50 
 
 		 3861 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1990  hypothetical protein  45.45 
 
 		 474 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.842738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0877  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  48.39 
 
 		 3822 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0168834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  50.82 
 
 		 3907 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0132  hypothetical protein  45.21 
 
 		 830 aa  57.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00263601  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  43.37 
 
 		 4009 aa  57  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  43.37 
 
 		 4022 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  46.15 
 
 		 1188 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1621  PA14 domain-containing protein  44.29 
 
 		 654 aa  55.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.459309  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 462 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  50.82 
 
 		 1332 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  48.48 
 
 		 4357 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  55.56 
 
 		 2374 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2490  hypothetical protein  58.54 
 
 		 188 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247761 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  50 
 
 		 1487 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  35.78 
 
 		 640 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1119  hypothetical protein  54.55 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.993118  normal  0.376129 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1908 aa  43.9  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3809  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 496 aa  43.1  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.100771  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  49.12 
 
 		 866 aa  43.1  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>