More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3122 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  100 
 
 
692 aa  1381    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  33.94 
 
 
758 aa  114  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  32.45 
 
 
3027 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  34.29 
 
 
223 aa  113  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  33.8 
 
 
1831 aa  112  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  34.48 
 
 
1226 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  37.08 
 
 
625 aa  110  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  36.78 
 
 
1194 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  34.02 
 
 
506 aa  108  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  33.82 
 
 
932 aa  107  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  32.35 
 
 
693 aa  105  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  38.64 
 
 
526 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 
1321 aa  105  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  32.34 
 
 
1821 aa  104  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  35.29 
 
 
1009 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  37.3 
 
 
1394 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  36.07 
 
 
573 aa  102  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  38.07 
 
 
531 aa  100  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  32.47 
 
 
754 aa  101  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  34.21 
 
 
1174 aa  98.6  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  34.46 
 
 
1081 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  31.22 
 
 
920 aa  98.2  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  35.32 
 
 
14609 aa  98.2  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  36.49 
 
 
1316 aa  97.8  6e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  32.11 
 
 
1710 aa  97.4  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  32.76 
 
 
926 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  32.8 
 
 
820 aa  94.7  5e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  31.82 
 
 
518 aa  92.8  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  34.46 
 
 
660 aa  92.8  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  37.56 
 
 
1188 aa  92.4  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  30.27 
 
 
629 aa  92  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  37.43 
 
 
548 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.25 
 
 
1328 aa  91.7  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  33.69 
 
 
457 aa  91.3  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  32.66 
 
 
1168 aa  90.9  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  38.74 
 
 
552 aa  90.9  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3123  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.5 
 
 
640 aa  90.1  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00188421  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  30.98 
 
 
524 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.46 
 
 
1016 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  31.07 
 
 
288 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  30.21 
 
 
618 aa  88.6  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  30.56 
 
 
1421 aa  89  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  37.84 
 
 
546 aa  88.2  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  28.9 
 
 
1154 aa  88.2  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  34.57 
 
 
631 aa  87.8  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  31.51 
 
 
585 aa  87.8  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  33.15 
 
 
767 aa  87.4  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  32.99 
 
 
935 aa  87.4  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4147  S-layer domain protein  30.19 
 
 
364 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662872  hitchhiker  0.00000166564 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  35.39 
 
 
710 aa  87  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  33.9 
 
 
1208 aa  87  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  31.58 
 
 
542 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.64 
 
 
1054 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  32.79 
 
 
548 aa  85.9  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  34.33 
 
 
685 aa  86.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  32.8 
 
 
4630 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  30.89 
 
 
2207 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.23 
 
 
1234 aa  84.7  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.52 
 
 
995 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2811  putative S-layer protein  30.18 
 
 
461 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000374812 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2613  S-layer protein  30.18 
 
 
461 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2803  S-layer protein  30.18 
 
 
461 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0432636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  31.32 
 
 
756 aa  83.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  28.5 
 
 
218 aa  83.2  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  32.02 
 
 
1013 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  34.09 
 
 
1223 aa  82  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  32.79 
 
 
462 aa  81.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.43 
 
 
1029 aa  81.6  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  28.88 
 
 
1260 aa  81.3  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  27.24 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2530  S-layer protein  29.28 
 
 
461 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000347347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3079  cellulosome anchoring protein, cohesin region  36.97 
 
 
688 aa  80.5  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  29.77 
 
 
807 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  34.23 
 
 
413 aa  79.7  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  30.56 
 
 
1847 aa  79.7  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.64 
 
 
2313 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2853  putative S-layer protein  30.24 
 
 
461 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000112389  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.35 
 
 
1231 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  30.77 
 
 
1042 aa  78.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  31.49 
 
 
624 aa  78.2  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  35.77 
 
 
921 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0683  S-layer domain protein  27.98 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  28.11 
 
 
554 aa  77.4  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  27.27 
 
 
880 aa  77  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  26.85 
 
 
575 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3093  S-layer domain-containing protein  30.95 
 
 
935 aa  76.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  40.85 
 
 
1487 aa  76.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3307  S-layer domain protein  28.38 
 
 
360 aa  75.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  35.14 
 
 
669 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  31.34 
 
 
693 aa  75.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  29.35 
 
 
376 aa  74.7  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0755  hypothetical protein  33.63 
 
 
1756 aa  74.7  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517989  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2160  S-layer protein  31.28 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.028807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2340  putative S-layer protein  31.28 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2315  S-layer protein  31.28 
 
 
383 aa  74.3  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  30.5 
 
 
506 aa  73.9  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  30.73 
 
 
760 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  32.12 
 
 
286 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2871  hypothetical protein  33.16 
 
 
767 aa  73.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0966428  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.91 
 
 
447 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>