25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1427 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1427  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  874    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3340  hypothetical protein  34.57 
 
 
425 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0388  hypothetical protein  34.67 
 
 
435 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1381  hypothetical protein  31.8 
 
 
434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2548  hypothetical protein  29.45 
 
 
389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.140695 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1271  hypothetical protein  73.08 
 
 
380 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.486206 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0464  hypothetical protein  30.41 
 
 
465 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00621297  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0766  hypothetical protein  27.84 
 
 
440 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.305198  normal  0.716911 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2512  membrane protein  59.04 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5171  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  53.42 
 
 
168 aa  86.7  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3002  Uncharacterized membrane-associated protein/domain-like protein  53.03 
 
 
248 aa  80.9  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3289  hypothetical protein  51.95 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0332  hypothetical protein  42.7 
 
 
378 aa  78.2  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2437  hypothetical protein  58.06 
 
 
469 aa  78.2  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813144  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3612  hypothetical protein  49.25 
 
 
388 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1765  hypothetical protein  44.79 
 
 
443 aa  75.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.569122  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2831  hypothetical protein  45 
 
 
202 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1865  hypothetical protein  50 
 
 
640 aa  65.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1142  hypothetical protein  49.21 
 
 
216 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0291  hypothetical protein  36.23 
 
 
327 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1421  hypothetical protein  29.59 
 
 
128 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1085  hypothetical protein  40.68 
 
 
290 aa  47  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1896  hypothetical protein  37.74 
 
 
330 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0508  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
453 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.508311  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1199  hypothetical protein  39.34 
 
 
181 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>