21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2330 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2330  hypothetical protein  100 
 
 
865 aa  1716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  56.96 
 
 
1394 aa  97.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  47.3 
 
 
830 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2776  Fibronectin type III domain protein  39.17 
 
 
823 aa  71.2  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000481721  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0619  Polymorphic membrane protein  34.65 
 
 
1216 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.418961  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0557  hypothetical protein  34.88 
 
 
295 aa  62.4  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3897  hypothetical protein  34.56 
 
 
859 aa  61.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00760567  normal  0.272372 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1919  hypothetical protein  31.08 
 
 
872 aa  58.9  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  48.89 
 
 
356 aa  58.2  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  33.65 
 
 
1656 aa  54.7  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  41.8 
 
 
605 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  48.78 
 
 
453 aa  52.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  29.33 
 
 
2313 aa  51.6  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  37.1 
 
 
1342 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  29.75 
 
 
3670 aa  48.9  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  36.23 
 
 
625 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  37.5 
 
 
916 aa  47  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47315  predicted protein  35.66 
 
 
504 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  38.82 
 
 
904 aa  45.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  42.7 
 
 
433 aa  45.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  46.58 
 
 
455 aa  44.3  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>