43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1026 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  815    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  31.46 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  32.39 
 
 		 401 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  30.49 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  32.21 
 
 		 491 aa  162  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  27.69 
 
 		 629 aa  114  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  27.41 
 
 		 391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  25.61 
 
 		 378 aa  104  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  29.74 
 
 		 840 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  26.59 
 
 		 870 aa  100  4e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  25.13 
 
 		 404 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  28.34 
 
 		 1131 aa  91.7  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  26.77 
 
 		 408 aa  90.1  6e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  24.94 
 
 		 626 aa  87  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  30.95 
 
 		 258 aa  87  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  25.28 
 
 		 417 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  23.5 
 
 		 559 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  23.5 
 
 		 553 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  34.88 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  24.49 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  23.66 
 
 		 481 aa  77.8  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  23.33 
 
 		 538 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  30 
 
 		 382 aa  67.4  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  21.36 
 
 		 1287 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  28.16 
 
 		 405 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  25.31 
 
 		 502 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  23.19 
 
 		 528 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  29.2 
 
 		 708 aa  60.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  29.75 
 
 		 917 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  27.82 
 
 		 387 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.29 
 
 		 769 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  24.86 
 
 		 501 aa  58.5  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  31.03 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  28.19 
 
 		 575 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  28.71 
 
 		 696 aa  54.3  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3488  hypothetical protein  23.38 
 
 		 669 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.03 
 
 		 1272 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  29.7 
 
 		 714 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  23.22 
 
 		 385 aa  46.6  0.0009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  21.74 
 
 		 472 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  24.79 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  26.47 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  25.83 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>