27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0869 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  100 
 
 
477 aa  974    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  26.17 
 
 
491 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  30.94 
 
 
626 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  24.84 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  27.03 
 
 
403 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  28.43 
 
 
401 aa  91.3  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  28.82 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  29.6 
 
 
559 aa  87.4  5e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  29.37 
 
 
258 aa  84  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  29.2 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  25.8 
 
 
538 aa  79.3  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  26.56 
 
 
840 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  25.67 
 
 
481 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  26.15 
 
 
629 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  29.46 
 
 
1131 aa  68.6  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  29.33 
 
 
200 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  26.74 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  27.63 
 
 
432 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  26.91 
 
 
417 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  22.19 
 
 
870 aa  57.4  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  31.03 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  22.87 
 
 
391 aa  55.8  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  23.9 
 
 
528 aa  53.5  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  22.57 
 
 
502 aa  51.2  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.57 
 
 
769 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  27.04 
 
 
940 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  23.57 
 
 
408 aa  43.1  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>