47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1752 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1070    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  31.39 
 
 		 400 aa  152  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  29.97 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  28.85 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  28.85 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  26.26 
 
 		 626 aa  125  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  33.15 
 
 		 870 aa  120  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  28.38 
 
 		 629 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  25.43 
 
 		 840 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  36.36 
 
 		 258 aa  97.4  6e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  35.06 
 
 		 417 aa  94.4  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  28.66 
 
 		 404 aa  93.6  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  25.07 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0640  hypothetical protein  32.28 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.277107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  23.7 
 
 		 559 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2059  hypothetical protein  28.78 
 
 		 502 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0769946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  23.95 
 
 		 553 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  24.27 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  26.77 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0869  hypothetical protein  25.8 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.099275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  28.14 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  30.77 
 
 		 408 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  23.33 
 
 		 410 aa  74.7  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  25.21 
 
 		 481 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  26.69 
 
 		 1131 aa  70.9  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  33.56 
 
 		 200 aa  67  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0095  hypothetical protein  31.15 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  25.56 
 
 		 382 aa  62.4  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0236  hypothetical protein  20.34 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  22.55 
 
 		 575 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  22.81 
 
 		 938 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  28.49 
 
 		 708 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2312  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.59 
 
 		 769 aa  53.5  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000905322  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  22.99 
 
 		 917 aa  53.5  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.65 
 
 		 1272 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  24.31 
 
 		 714 aa  50.4  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  28.33 
 
 		 679 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  27.47 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  27.83 
 
 		 463 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  20.59 
 
 		 940 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  27.22 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  27.48 
 
 		 429 aa  44.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  27.95 
 
 		 436 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  22.95 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1287 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  27.4 
 
 		 460 aa  43.9  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  26.86 
 
 		 456 aa  43.5  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>