58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1550 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  755    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  31.12 
 
 		 400 aa  157  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  33.04 
 
 		 491 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  30.43 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  31.35 
 
 		 401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  29.03 
 
 		 626 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  26.94 
 
 		 378 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  30.49 
 
 		 1131 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  27.49 
 
 		 629 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  28.33 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  27.02 
 
 		 528 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  33.2 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  27.03 
 
 		 840 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  29.17 
 
 		 408 aa  93.6  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  29.02 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  30.53 
 
 		 917 aa  71.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  25.35 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  23.01 
 
 		 940 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  22.53 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  30 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  26.12 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  30.17 
 
 		 200 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.34 
 
 		 1272 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  25.56 
 
 		 538 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  26.06 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  28.21 
 
 		 870 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  24.46 
 
 		 472 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2666  hypothetical protein  29.32 
 
 		 559 aa  59.7  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00626292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  25.97 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  29.77 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  25.51 
 
 		 4433 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  26.75 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.63 
 
 		 708 aa  56.6  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  25 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  35.29 
 
 		 3507 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3731  hypothetical protein  28.11 
 
 		 553 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.280958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  26.81 
 
 		 456 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  29.05 
 
 		 463 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  25.75 
 
 		 450 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1245  Pyrrolo-quinoline quinone  28.81 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  28.76 
 
 		 714 aa  52.4  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.1 
 
 		 2068 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  26.51 
 
 		 480 aa  50.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  25.1 
 
 		 938 aa  49.7  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  24.3 
 
 		 688 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.02 
 
 		 1848 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1287 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  30.43 
 
 		 950 aa  46.6  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  21.88 
 
 		 938 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 696 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  25.29 
 
 		 2286 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  31.91 
 
 		 858 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1663  hypothetical protein  23.89 
 
 		 575 aa  44.7  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.35 
 
 		 2807 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1449  hypothetical protein  23.97 
 
 		 411 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.239612  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  27.33 
 
 		 3295 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  22.22 
 
 		 513 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  29.14 
 
 		 460 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>