63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2615 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1036    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  57.92 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  38.07 
 
 		 456 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  39.95 
 
 		 471 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  38.1 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  36.97 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  35.7 
 
 		 436 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  35.66 
 
 		 439 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  30.48 
 
 		 450 aa  111  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  30.71 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  46.02 
 
 		 3507 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.26 
 
 		 1272 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  27.27 
 
 		 4433 aa  93.2  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 2068 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  30.9 
 
 		 460 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  27.18 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  26.99 
 
 		 940 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  25.49 
 
 		 938 aa  79  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  26.61 
 
 		 668 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 688 aa  76.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  29.41 
 
 		 2286 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  28.97 
 
 		 930 aa  74.3  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  28.18 
 
 		 831 aa  73.6  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  26.96 
 
 		 400 aa  72.4  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  27.34 
 
 		 676 aa  70.5  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  27.42 
 
 		 491 aa  69.3  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  24.82 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.09 
 
 		 1848 aa  67.8  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  27.65 
 
 		 627 aa  67.4  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  28.45 
 
 		 579 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  26.8 
 
 		 378 aa  66.2  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.63 
 
 		 930 aa  65.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  23.24 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  33.54 
 
 		 917 aa  63.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  28.38 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.08 
 
 		 346 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.74 
 
 		 343 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  25.82 
 
 		 403 aa  61.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  27.32 
 
 		 708 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  26.64 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.39 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 		 396 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  22.62 
 
 		 696 aa  54.7  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  24.85 
 
 		 588 aa  53.9  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  26.47 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.46 
 
 		 447 aa  51.6  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  23.49 
 
 		 3295 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  24.41 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  28.14 
 
 		 752 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  23.76 
 
 		 603 aa  50.4  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  30.04 
 
 		 387 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  29.73 
 
 		 1976 aa  48.5  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  27.57 
 
 		 801 aa  47.8  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  22.38 
 
 		 2554 aa  47  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  21.17 
 
 		 1329 aa  47  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  23.28 
 
 		 709 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1969 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  24.79 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  24.22 
 
 		 553 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  22.89 
 
 		 629 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  28.46 
 
 		 1531 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  21.93 
 
 		 382 aa  43.9  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  26.11 
 
 		 390 aa  43.9  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>