58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1956 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  100 
 
 
917 aa  1827    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  31.5 
 
 
950 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  30.27 
 
 
472 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  27.63 
 
 
688 aa  97.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  29.26 
 
 
626 aa  93.2  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1286  lipoprotein, putative  27.81 
 
 
400 aa  89  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000296696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  27.31 
 
 
940 aa  86.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  26.8 
 
 
491 aa  81.3  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1288  lipoprotein, putative  26.09 
 
 
401 aa  80.5  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000049717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0436  lipoprotein, putative  29.9 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000132569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  30.73 
 
 
938 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7451  esterase-like protein  32.34 
 
 
708 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.386767 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  30.34 
 
 
463 aa  76.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1424  hypothetical protein  28.89 
 
 
840 aa  74.3  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.313728  hitchhiker  0.000424161 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  30.45 
 
 
432 aa  74.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0329  fibronectin, type III  32.37 
 
 
439 aa  73.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0676693  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2614  hypothetical protein  40.74 
 
 
480 aa  73.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0704737  normal  0.554732 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1289  lipoprotein, putative  25.7 
 
 
403 aa  72.4  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000309477  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  30.53 
 
 
382 aa  72  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0178  cellulose-binding  29.85 
 
 
436 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  32.89 
 
 
430 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1444  hypothetical protein  29.95 
 
 
258 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000800024  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0030  exported nucleotide-binding protein  28.44 
 
 
696 aa  69.7  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1109  fibronectin, type III  30.04 
 
 
456 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  24.5 
 
 
870 aa  66.6  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  27.93 
 
 
1131 aa  66.2  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  25.37 
 
 
629 aa  65.5  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0441  hypothetical protein  28.44 
 
 
378 aa  64.7  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2739  hypothetical protein  27.64 
 
 
417 aa  64.3  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.182457  hitchhiker  0.000161198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2615  hypothetical protein  34.36 
 
 
513 aa  63.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00127521  normal  0.545768 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.3 
 
 
1272 aa  62.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  32.11 
 
 
2068 aa  62.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1108  hypothetical protein  29.09 
 
 
471 aa  62.8  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3046  hypothetical protein  24.07 
 
 
528 aa  62.4  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04420  hypothetical protein  25.99 
 
 
481 aa  61.2  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1026  hypothetical protein  29.75 
 
 
410 aa  60.8  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000494249  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0125  hypothetical protein  23.39 
 
 
714 aa  58.9  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1046  hypothetical protein  24.26 
 
 
404 aa  58.9  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196916  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0408  hypothetical protein  29.01 
 
 
450 aa  58.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.218679  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1490  hypothetical protein  28.47 
 
 
200 aa  58.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000902268  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  31.28 
 
 
501 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2299  fibronectin, type III  29.87 
 
 
485 aa  57  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0568  PKD domain containing protein  31.01 
 
 
553 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0964666  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  30.49 
 
 
2554 aa  55.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  28 
 
 
1976 aa  55.1  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.17 
 
 
1848 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0738  hypothetical protein  28.03 
 
 
408 aa  54.3  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1752  hypothetical protein  24.4 
 
 
538 aa  52.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6283  hypothetical protein  29.3 
 
 
421 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  28.57 
 
 
2286 aa  52.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.46 
 
 
1969 aa  52.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  25.67 
 
 
3507 aa  51.6  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.81 
 
 
4433 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2495  hypothetical protein  29.34 
 
 
460 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  22.97 
 
 
603 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6183  hypothetical protein  26.7 
 
 
523 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0435298 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0420  hypothetical protein  24.77 
 
 
582 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49624  predicted protein  27.07 
 
 
855 aa  46.2  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>