17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2882 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2882  regulatory protein FlaEY  100 
 
 
950 aa  1884    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0301569  normal  0.06195 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1956  regulatory protein FlaEY  31.56 
 
 
917 aa  384  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0297  hemolysin-type calcium-binding region  31.49 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.327634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2225  hypothetical protein  28.66 
 
 
430 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.184781 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1915  putative secreted protein  27.95 
 
 
501 aa  55.1  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414715  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0724  PKD domain containing protein  26.61 
 
 
432 aa  52.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  34.86 
 
 
688 aa  52  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  30.15 
 
 
940 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  32.74 
 
 
1969 aa  48.9  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4747  cell surface glycoprotein (s-layer protein) related protein-like  26.25 
 
 
801 aa  47.8  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0992088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1107  hypothetical protein  29.59 
 
 
463 aa  47.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.655158  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1550  hypothetical protein  30.43 
 
 
382 aa  47  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000114409  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  25.49 
 
 
938 aa  47  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  34.72 
 
 
2554 aa  44.7  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  29.68 
 
 
603 aa  44.7  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0418  PKD  24.85 
 
 
626 aa  44.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  28.28 
 
 
1131 aa  44.7  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>