82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0791 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  100 
 
 		 692 aa  1420    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  49.08 
 
 		 1406 aa  247  4e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  42.24 
 
 		 778 aa  197  5.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  48.84 
 
 		 1152 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  47.78 
 
 		 1362 aa  83.2  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.93 
 
 		 915 aa  78.2  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  47.62 
 
 		 984 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  42.05 
 
 		 966 aa  74.3  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  38.32 
 
 		 846 aa  72.4  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  24.23 
 
 		 486 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  26.27 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  45.12 
 
 		 703 aa  68.6  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  37.63 
 
 		 1123 aa  65.1  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  35.96 
 
 		 963 aa  64.3  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  23.32 
 
 		 587 aa  63.9  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  35.79 
 
 		 1132 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28 
 
 		 682 aa  63.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  44.16 
 
 		 1414 aa  63.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  26.79 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.69 
 
 		 595 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  23.81 
 
 		 1537 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  43.66 
 
 		 1275 aa  61.6  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 1127 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  36.56 
 
 		 1002 aa  61.2  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  39.18 
 
 		 1051 aa  60.1  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  24.52 
 
 		 830 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  33.33 
 
 		 991 aa  59.7  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  43.75 
 
 		 979 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  37.93 
 
 		 1247 aa  60.1  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  35.56 
 
 		 767 aa  59.7  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  23.03 
 
 		 680 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  39.8 
 
 		 1146 aa  58.5  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  34.55 
 
 		 1601 aa  58.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  40.26 
 
 		 846 aa  58.5  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  37.36 
 
 		 1127 aa  58.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  36.14 
 
 		 1059 aa  57.4  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  32.17 
 
 		 1474 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  36.9 
 
 		 1217 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  36.9 
 
 		 1585 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  41.56 
 
 		 846 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0253  hypothetical protein  38.24 
 
 		 885 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  35.16 
 
 		 1127 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25.32 
 
 		 575 aa  55.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  33.72 
 
 		 1295 aa  54.7  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  41.25 
 
 		 587 aa  54.7  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.39 
 
 		 680 aa  55.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  41.56 
 
 		 848 aa  54.3  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  34.15 
 
 		 1054 aa  53.5  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  36.78 
 
 		 974 aa  53.5  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  40.59 
 
 		 343 aa  52.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  36.11 
 
 		 499 aa  53.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.54 
 
 		 609 aa  53.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  34.44 
 
 		 1127 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  24.21 
 
 		 529 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0344  hypothetical protein  35.11 
 
 		 880 aa  51.6  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.36736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  23.23 
 
 		 666 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  31.45 
 
 		 1096 aa  51.2  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  41.11 
 
 		 1160 aa  50.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.5 
 
 		 590 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  26.72 
 
 		 684 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  35.8 
 
 		 1748 aa  50.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  22.41 
 
 		 680 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 1224 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  28.57 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  35.16 
 
 		 491 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  34.07 
 
 		 1219 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  36.47 
 
 		 1053 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  21.99 
 
 		 824 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  32.93 
 
 		 1129 aa  48.5  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.49 
 
 		 627 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  40.74 
 
 		 482 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  37.27 
 
 		 675 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.65 
 
 		 587 aa  47.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  33.33 
 
 		 676 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  27.68 
 
 		 663 aa  46.6  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.23 
 
 		 693 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  24.03 
 
 		 674 aa  45.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  24.87 
 
 		 406 aa  44.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  37.96 
 
 		 827 aa  44.3  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  34.69 
 
 		 1302 aa  44.3  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  30.54 
 
 		 606 aa  44.3  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  20.43 
 
 		 444 aa  43.9  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>