46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0784 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  100 
 
 
444 aa  903    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1288  fibronectin type III domain-containing protein  38.92 
 
 
394 aa  263  6e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1219  fibronectin type III domain-containing protein  38.12 
 
 
388 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  35.18 
 
 
404 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  36.65 
 
 
404 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  34.97 
 
 
410 aa  232  1e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  34.72 
 
 
410 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  35.23 
 
 
409 aa  228  1e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0508  diaminopimelate decarboxylase dap decarboxylase  44.13 
 
 
181 aa  160  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  25.43 
 
 
741 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.25 
 
 
649 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.1 
 
 
795 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.4 
 
 
455 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.4 
 
 
455 aa  57  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  22.22 
 
 
1462 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.23 
 
 
455 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  25.9 
 
 
1628 aa  53.5  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  30.23 
 
 
455 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.38 
 
 
6885 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  27.66 
 
 
779 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  28.49 
 
 
455 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  26.11 
 
 
1199 aa  50.1  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  23.77 
 
 
9585 aa  50.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  30.46 
 
 
455 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  24.84 
 
 
211 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  23.53 
 
 
1695 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  29.07 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  23.08 
 
 
782 aa  49.3  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  29.07 
 
 
455 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  23.88 
 
 
667 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  27.37 
 
 
459 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  28.47 
 
 
717 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  27.27 
 
 
456 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  30.46 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  30.95 
 
 
1753 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  27.91 
 
 
455 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  28.73 
 
 
3802 aa  47.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  33.33 
 
 
3507 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  28.11 
 
 
454 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  26.63 
 
 
1247 aa  45.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  25.49 
 
 
458 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  26.56 
 
 
455 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1632  Fibronectin type III domain protein  32.04 
 
 
377 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  28.05 
 
 
1248 aa  43.5  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  24.49 
 
 
970 aa  43.1  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  28.48 
 
 
527 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>