54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1219 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1219  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
388 aa  788    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1288  fibronectin type III domain-containing protein  47.68 
 
 
394 aa  347  3e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  43.83 
 
 
404 aa  328  7e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  45.45 
 
 
410 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  44.89 
 
 
410 aa  324  1e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  44.89 
 
 
409 aa  322  8e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  42.18 
 
 
404 aa  315  9e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  38.12 
 
 
444 aa  253  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0508  diaminopimelate decarboxylase dap decarboxylase  60.44 
 
 
181 aa  232  7.000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  27.63 
 
 
741 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  23.61 
 
 
1462 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.52 
 
 
6885 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  23.81 
 
 
680 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  30.47 
 
 
771 aa  62  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  24.57 
 
 
9585 aa  60.8  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.56 
 
 
795 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  25.6 
 
 
455 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  26.09 
 
 
455 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  25.69 
 
 
1628 aa  55.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  27.08 
 
 
455 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  23.55 
 
 
779 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
1230 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  28.36 
 
 
455 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  28.36 
 
 
455 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  27.08 
 
 
455 aa  53.1  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  24.6 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  28.89 
 
 
1199 aa  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0196  fibronectin, type III  29.02 
 
 
354 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3451  hypothetical protein  23.54 
 
 
687 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00623821 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  23.08 
 
 
3802 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.36 
 
 
455 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  25.6 
 
 
455 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  26.03 
 
 
836 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  25.6 
 
 
455 aa  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  23.97 
 
 
1307 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  26.26 
 
 
1160 aa  49.7  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  38 
 
 
1643 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  25.29 
 
 
455 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  24.85 
 
 
480 aa  49.3  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  24.28 
 
 
667 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  23.72 
 
 
454 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  24.31 
 
 
458 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  24.88 
 
 
456 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  25.37 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  30.43 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  28.65 
 
 
211 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  25.42 
 
 
1042 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  30.63 
 
 
762 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  30.12 
 
 
941 aa  43.5  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  25.2 
 
 
1695 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  31.82 
 
 
458 aa  43.1  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.06 
 
 
649 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  22.12 
 
 
2068 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  23 
 
 
1401 aa  42.7  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>