33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6593 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 428 aa  850    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  33.22 
 
 		 9585 aa  97.4  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  32.46 
 
 		 1462 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  36.51 
 
 		 1067 aa  84.3  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  31.18 
 
 		 782 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  24.67 
 
 		 795 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  36.26 
 
 		 1550 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  24.83 
 
 		 1628 aa  59.3  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  24.19 
 
 		 3333 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  29.15 
 
 		 864 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.82 
 
 		 1787 aa  54.3  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  29.38 
 
 		 1199 aa  54.3  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  28.78 
 
 		 865 aa  53.9  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  34.74 
 
 		 680 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  31.75 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  27.27 
 
 		 692 aa  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  26.61 
 
 		 2272 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  30.88 
 
 		 2047 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  26.73 
 
 		 744 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  25.62 
 
 		 1063 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  30 
 
 		 2179 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  26.15 
 
 		 741 aa  47  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 		 725 aa  46.6  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  25 
 
 		 3027 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  27.57 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.22 
 
 		 648 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  31.58 
 
 		 1847 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  25.93 
 
 		 1172 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  25.31 
 
 		 2069 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 		 701 aa  43.9  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  33.71 
 
 		 548 aa  43.5  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  24.38 
 
 		 667 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  35.05 
 
 		 277 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>