27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6932 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6932  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 345 aa  692    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7189  lipolytic protein G-D-S-L family  39.83 
 
 		 343 aa  196  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09213  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 		 847 aa  187  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0180  lipolytic protein G-D-S-L family  35.11 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.743326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2470  fibronectin, type III  30.42 
 
 		 506 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3711  lipolytic protein G-D-S-L family  32.01 
 
 		 612 aa  90.1  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.106997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  36.72 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0078  Carbohydrate binding family 6  28.84 
 
 		 1234 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.511687 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  35.11 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  26.12 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1831  cellulose-binding family II  33.05 
 
 		 374 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3537  Ricin B lectin  34.19 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0768059  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4850  lipolytic protein G-D-S-L family  37.5 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0748  lipolytic protein G-D-S-L family  27.23 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0991  lipolytic protein G-D-S-L family  26.75 
 
 		 828 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.978683  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  28.63 
 
 		 749 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  31.75 
 
 		 428 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2115  lipolytic protein G-D-S-L family  25.32 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  28.3 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0404  Carbohydrate binding family 6  30.45 
 
 		 468 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.813596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1877  lipolytic protein G-D-S-L family  27.04 
 
 		 576 aa  49.7  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2225  lipolytic protein G-D-S-L family  26.71 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0184317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  21.88 
 
 		 681 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04660  acyl-CoA thioesterase I  30.95 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3742  Ricin B lectin  25.11 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  0.957672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3994  hypothetical protein  25.11 
 
 		 256 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3108  Ricin B lectin  25.76 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>