46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4818 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  33.2 
 
 		 2067 aa  709    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 2069 aa  3942    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  31.59 
 
 		 2056 aa  612  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  32.98 
 
 		 2039 aa  602  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  31.13 
 
 		 2084 aa  560  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  31.46 
 
 		 2040 aa  561  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  32.22 
 
 		 2027 aa  563  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  30.59 
 
 		 2051 aa  560  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1329  hypothetical protein  40.32 
 
 		 1001 aa  552  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.031741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  29.89 
 
 		 2011 aa  525  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  32.16 
 
 		 2047 aa  526  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  30.96 
 
 		 2052 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 		 2043 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0957  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1994 aa  405  1e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.736873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1330  Fibronectin type III domain protein  34.34 
 
 		 1052 aa  335  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  31.13 
 
 		 9585 aa  110  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  27.13 
 
 		 721 aa  82.8  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  28.57 
 
 		 864 aa  70.1  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  23.98 
 
 		 1367 aa  68.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  32.55 
 
 		 1628 aa  66.2  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  28.69 
 
 		 865 aa  64.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  32.14 
 
 		 680 aa  61.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  30.37 
 
 		 1879 aa  60.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  39.34 
 
 		 2192 aa  60.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  22.56 
 
 		 1363 aa  58.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.62 
 
 		 994 aa  57.4  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  25.92 
 
 		 1597 aa  57  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  31.63 
 
 		 448 aa  55.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  45.71 
 
 		 744 aa  52.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.99 
 
 		 3816 aa  52  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  25.55 
 
 		 3191 aa  51.2  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  29.68 
 
 		 1269 aa  50.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  33.33 
 
 		 516 aa  49.3  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.44 
 
 		 761 aa  49.3  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4139  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.08 
 
 		 4122 aa  48.9  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  21.71 
 
 		 454 aa  48.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  38.46 
 
 		 3544 aa  47.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  31.79 
 
 		 1408 aa  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  31.79 
 
 		 1410 aa  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  31.79 
 
 		 1410 aa  48.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.63 
 
 		 3699 aa  47.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  36.67 
 
 		 2476 aa  47  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  27.18 
 
 		 1199 aa  46.6  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  25.88 
 
 		 2816 aa  46.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  33.05 
 
 		 3911 aa  46.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  28.1 
 
 		 725 aa  45.8  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>