73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0529 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 		 448 aa  871    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  33.58 
 
 		 480 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  30.41 
 
 		 9585 aa  93.6  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  32.42 
 
 		 701 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  31.53 
 
 		 2170 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  31.18 
 
 		 1199 aa  72  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.51 
 
 		 1628 aa  67  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  31.75 
 
 		 2011 aa  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  29.63 
 
 		 1221 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0459  Fibronectin type III domain protein  36.84 
 
 		 2043 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  33.99 
 
 		 2052 aa  64.3  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  37.44 
 
 		 3911 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  31.1 
 
 		 2040 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  28.2 
 
 		 680 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  29.07 
 
 		 1248 aa  60.1  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  30.26 
 
 		 999 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  30.66 
 
 		 864 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  28.4 
 
 		 1247 aa  57.4  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  31.12 
 
 		 2084 aa  56.6  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  27.89 
 
 		 2056 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 		 658 aa  55.1  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4818  Fibronectin type III domain protein  31.63 
 
 		 2069 aa  54.3  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  31.68 
 
 		 1272 aa  53.5  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  32.68 
 
 		 2067 aa  53.5  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2003  Fibronectin type III domain protein  29.63 
 
 		 725 aa  53.1  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333921  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  41.58 
 
 		 1879 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  34.59 
 
 		 1363 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  30.17 
 
 		 580 aa  50.8  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  34.59 
 
 		 1363 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  27.46 
 
 		 2039 aa  50.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  29.15 
 
 		 768 aa  50.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  28.95 
 
 		 2051 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  34.59 
 
 		 1380 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  31.21 
 
 		 771 aa  49.7  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  30.17 
 
 		 1050 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  31.2 
 
 		 1633 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  35.4 
 
 		 1625 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  34.74 
 
 		 903 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  26.6 
 
 		 1887 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0484  Fibronectin type III domain protein  28.45 
 
 		 2027 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  31.52 
 
 		 938 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  29.59 
 
 		 2334 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 2178 aa  47  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  42.03 
 
 		 868 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  34.53 
 
 		 1299 aa  46.6  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0044  Fibronectin type III domain protein  30.22 
 
 		 743 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  30.06 
 
 		 1089 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  36.92 
 
 		 997 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  29.2 
 
 		 2047 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0029  fibronectin, type III  38.04 
 
 		 742 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.795527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  27.56 
 
 		 861 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  32.86 
 
 		 744 aa  45.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  35.35 
 
 		 918 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  38.24 
 
 		 2503 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  28.26 
 
 		 1067 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  32.99 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  28.5 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  31.33 
 
 		 409 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.65 
 
 		 2068 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  36.27 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  50 
 
 		 566 aa  44.7  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  28.19 
 
 		 4433 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  34.56 
 
 		 2286 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.25 
 
 		 3699 aa  43.9  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  22.96 
 
 		 1224 aa  44.3  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  32.51 
 
 		 1007 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  29.35 
 
 		 2286 aa  44.3  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.89 
 
 		 809 aa  43.9  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  27.68 
 
 		 3027 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  30.96 
 
 		 656 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  31.78 
 
 		 2042 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0022  fibronectin type III domain-containing protein  23.75 
 
 		 730 aa  43.1  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0168573  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  27.05 
 
 		 1004 aa  43.1  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>