20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1621 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  908    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1503  cell wall/surface repeat protein  87.22 
 
 		 446 aa  746    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  71.97 
 
 		 432 aa  661    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  31.95 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1403  hypothetical protein  30.41 
 
 		 509 aa  67  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0229989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1185  hypothetical protein  29.68 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00163792  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  34.65 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  26.7 
 
 		 1263 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1212  hypothetical protein  29.95 
 
 		 510 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000290605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3245  hypothetical protein  29.81 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1390 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1027 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.77 
 
 		 2156 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  35.53 
 
 		 864 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  27.06 
 
 		 4357 aa  50.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1386  hypothetical protein  22.77 
 
 		 966 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000313408  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1978  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase  43.75 
 
 		 797 aa  46.6  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  27.95 
 
 		 940 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  24.32 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  36.99 
 
 		 1081 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>